Infections de l’appareil respiratoire

Les infections respiratoires ont été responsables de 11,3 millions de décès dans le monde en 2021,⁴ et sont causées par une grande variété d’agents pathogènes. Les virus tels que les virus de la grippe A et B, le virus respiratoire syncytial (VRS) et le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) focalisent beaucoup l’attention, mais des symptômes similaires peuvent également être dus à d’autres agents, notamment des bactéries telles que Streptococcus et Mycobacterium tuberculosis (MTB, TB).

Grippe : la grippe est une maladie respiratoire saisonnière qui survient chaque année, son pic étant généralement atteint en hiver. Elle touche 5 à 10 % des adultes et 20 à 30 % des enfants chaque année.⁵ Les épidémies saisonnières peuvent entraîner une hospitalisation et le décès, principalement chez les groupes à haut risque (les très jeunes, les personnes âgées ou les malades chroniques). On estime que les épidémies annuelles dans le monde entraînent 3 à 5 millions de cas de maladies graves et 290 000 à 650 000 décès.⁶

VRS : le VRS est une infection virale respiratoire aiguë qui touche, selon les estimations, presque tous les enfants avant l’âge de deux ans et qui peut entraîner une maladie grave et le décès. On estime qu’il représente 3,2 millions d’hospitalisations et jusqu’à 149 400 décès par an.⁷ Il existe une disparité dans la charge de morbidité entre les pays, 95 % des épisodes d’infection chez les jeunes enfants survenant dans les pays à revenu faible ou intermédiaire.⁸ Le VRS peut également affecter les adultes et est de plus en plus reconnu comme une cause de maladie grave chez les adultes de plus de 60 ans.⁹

SARS-CoV-2 (Covid-19) : à ce jour, le Covid-19 a causé plus de sept millions de décès dans le monde.¹⁰ Bien qu’il ne soit plus considéré comme une urgence sanitaire mondiale, le virus continue de circuler et de muter, avec des conséquences graves persistantes pour certains, comme les hospitalisations et les décès. L’OMS a fait état d’une augmentation de 42 % des hospitalisations et de 62 % des admissions en unité de soins intensifs en décembre 2023 par rapport à novembre 2023, et de près de 10 000 décès dus au Covid-19 au cours de la même période.¹¹

Streptocoque du groupe A (GAS) : le GAS est transmis dans la gorge ou la peau des êtres humains, avec des infections atteignant leur maximum pendant les mois d’hiver et affectant fréquemment les enfants d’âge scolaire. Les maladies sont généralement bénignes, telles que l'amygdalite, la pharyngite et l'impétigo. Cependant, dans de rares cas, l’infection par le GAS peut entraîner un GAS invasif qui provoque des affections potentiellement mortelles telles que la fasciite nécrosante et le syndrome de choc toxique streptococcique. Le GAS est responsable de plus de 500 000 décès dans le monde chaque année.¹²

Tuberculose : en tant que maladie infectieuse la plus mortelle au monde, la tuberculose (TB) a infecté 10,8 millions de personnes en 2023, dont 1,3 million d’enfants, et a causé plus de 1,25 million de décès. Causée par le bacille Mycobacterium tuberculosis (MTB), la co-infection par la TB avec le VIH et d’autres agents pathogènes complique encore les stratégies diagnostiques et thérapeutiques pour les patients. Alors que la TB infecte l’homme dans le monde, la maladie est prévalente dans 30 pays fortement touchés par la TB, qui représentent 87 % des infections par la TB dans le monde.¹³

L’identification de la cause sous-jacente d’une infection respiratoire est essentielle pour assurer un traitement approprié et une utilisation efficace des ressources. Cependant, cela peut être difficile pour de nombreuses raisons.

Signes et symptômes similaires

La présentation clinique non spécifique des infections respiratoires représente un défi considérable pour le diagnostic différentiel des agents pathogènes. Par exemple, les symptômes de la grippe (y compris fièvre, maux de tête, mal de gorge, douleurs musculaires, courbatures, écoulement nasal, fatigue et toux sèche) se chevauchent avec de nombreuses infections de l’appareil respiratoire supérieur et inférieur causées par d’autres agents pathogènes bactériens et/ou viraux. Cela rend difficile le diagnostic fondé sur les seuls symptômes pour les médecins.¹⁴

Surprescription d’antibiotiques

Dans les établissements de soins primaires, un traitement empirique par antibiotiques est fréquemment instauré même lorsqu’une infection virale est fortement probable, conduisant à une prescription inutile ou inappropriée d’antibiotiques¹⁵. Un diagnostic précoce et précis est essentiel pour identifier la cause d’une infection respiratoire et assurer un traitement antimicrobien approprié. Par exemple, l’utilisation de tests moléculaires au point de soins capables de détecter de manière fiable des agents pathogènes viraux et/ou bactériens entraînerait une amélioration des soins, une diminution de l’antibiothérapie empirique et une réduction des coûts de la maladie pour les patients et la société.

Complexité et sensibilité des tests

La culture bactérienne était la norme de référence traditionnelle pour le diagnostic. Cependant, cette méthode présente des inconvénients, car elle peut être exigeante en main-d'œuvre, nécessite un haut niveau d'expertise technique et a un long délai de résultat.¹⁶ Pour optimiser le délai de traitement, le diagnostic des infections aiguës de l’appareil respiratoire ne peut pas reposer uniquement sur la méthode traditionnelle de culture. C’est pourquoi d’autres méthodes de détection ont été développées pour améliorer la sensibilité, la spécificité et le temps de détection des agents pathogènes responsables des infections de l’appareil respiratoire.

Les méthodes diagnostiques actuelles couramment utilisées sont les tests antigéniques rapides sur le lieu de soins, les tests moléculaires sur le lieu de soins et les tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) en laboratoire.^17,18 Les cliniciens doivent déterminer quel test est le plus approprié, car bien que les tests PCR soient très sensibles, le délai de rendu des résultats est plus long qu’un test antigénique. D’autre part, les tests de détection d’antigènes sont généralement moins sensibles et peuvent donner lieu à des faux négatifs.

La précision des tests est importante, car les résultats faussement négatifs peuvent poser un risque médical grave pour les patients et pourraient entraîner une propagation ultérieure du virus à d’autres personnes. D’un autre côté, des résultats faussement positifs peuvent amener les personnes à croire qu’elles ont été exposées au virus et qu’elles ont développé des anticorps, alors qu’en fait, ce n’est pas le cas.

Sous-diagnostic

Au cours des 20 dernières années aux États-Unis, seul un faible pourcentage des personnes présentant un syndrome pseudo-grippal ont été testées et, parmi celles-ci, seules 23 % à 43 % au cours de la période d'activité maximale étaient associées à un test positif pour la grippe.¹⁹ Par conséquent, bien que le test ait un rôle clair à jouer dans le diagnostic précis de la maladie respiratoire, il n'est pas toujours utilisé. Les raisons de cet écart peuvent être liées au financement, à l’accès à des tests appropriés et même à la perception des dangers des virus respiratoires.¹⁹

Le sous-diagnostic représente un défi majeur pour l’objectif de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) d’éliminer la tuberculose d’ici 2030. En 2023, seulement 63 % des personnes ayant reçu un diagnostic récent de tuberculose pulmonaire ont été confirmées biologiquement par un test moléculaire. Cela signifie que 3 millions de patients atteints de tuberculose n’ont pas reçu de test moléculaire pour confirmer le diagnostic.²⁰ Pour atteindre ces objectifs d’élimination de la tuberculose, les agences de santé, les gouvernements nationaux et d’autres parties prenantes ont souligné la nécessité de diagnostics innovants afin que les cliniciens puissent recevoir les informations nécessaires pour diagnostiquer correctement les infections, améliorer l’accès au traitement et réduire la transmission de la maladie.

Les premiers soins jouent un rôle essentiel dans le diagnostic et la prise en charge des infections respiratoires, les symptômes respiratoires étant la raison la plus fréquente des consultations en premiers soins.²³

La plateforme cobas® liat de Roche propose des tests ciblés et au chevet du patient, multi- et mono-cibles, avec des résultats en quelques minutes. Les tests respiratoires rapides permettent aux cliniciens de fournir des conseils, des orientations et un traitement appropriés au bon moment et au bon endroit. Le transfert des tests respiratoires aux cliniques locales et à la communauté pourrait également réduire la pression sur les prestataires de premiers soins et soins secondaires

Le système Roche cobas® LIAT fournit des tests PCR de référence sur le lieu des soins :^21,22

• Tests multiplex rapides de première ligne couvrant des cibles respiratoires communes
• Facile à utiliser avec moins d’une minute de manipulation et une interface intuitive facile à utiliser
• Les résultats cliniquement exploitables pour la grippe A/B et le SARS-CoV-2 sont disponibles en 20  
• Petite taille adaptée à n’importe quelle clinique, aux soins d’urgence ou à un site satellite

Dans les cas complexes, les cliniciens ont besoin d’une fiabilité diagnostique pour le traitement et la prescription les plus appropriés.

Roche offre une couverture complète qui peut identifier les infections au-delà de la grippe, du SARS-CoV-2 et du VRS et même les co-infections. Les résultats peuvent être utilisés pour guider les recommandations d’isolement afin de prévenir la propagation de l’infection à d’autres patients.

Roche cobas® eplex fournit des tests syndromiques rapides et complets de plus de 20 cibles respiratoires pour les patientsà haut risque^21,22

• Flux de travail facile à utiliser avec moins d’une minute de manipulation
• Résultats urgents et exploitables pour les patients à haut risque
• Accès aléatoire et continu pour effectuer des tests sur tous les quarts
• Modulaire et évolutif

Il est particulièrement important d’alléger le fardeau des médecins et du personnel de laboratoire sousmis à de fortes pressions pendant une vague hivernale. Les tests multiplex permettent au personnel de laboratoire soumis à de fortes pressions de se concentrer sur les cas prioritaires.

Roche propose des tests syndromiques flexibles à haut débit et personnalisables. Les cliniciens peuvent prescrire des tests respiratoires optimisés pour les environnements et tenir compte de la saisonnalité, de la dynamique locale et des cohortes de patients.

Roche cobas® Respiratory flex pour une utilisation sur les systèmes cobas® 5800/6800/8800 délivre une technologie PCR de référence offrant des tests respiratoires ciblés, flexibles et fiables, inédits^21,22

• Tests multiplex dans les hôpitaux pour les 12 agents pathogènes respiratoires viraux les plus courants
• Les réactifs et l’automatisation pré-étalonnés prêts à l’emploi nécessitent une interaction minimale du technicien
• Cadence la plus élevée et plus longue durée d’autonomie disponible parmi les plateformes moléculaires automatisées