Séquençage

Des solutions performantes et efficaces pour le séquençage de nouvelle génération (NGS).


Scientifique de laboratoire se préparant à séquencer de l’ADN

Tracer les futures voies pour le séquençage grâce à une innovation, une expertise et un partenariat fiables

Solution

Des solutions complètes de NGS pour la recherche et au-delà

Le séquençage de nouvelle génération (NGS) est un outil indispensable, mais l’univers en constante mutation des types d’échantillons, des applications et des technologies rend difficile la sélection du meilleur protocole de séquençage. 

Roche donne les moyens à chaque étape de votre flux de travail grâce à une gamme complète de solutions de NGS, vous permettant de découvrir, de comprendre et d’agir en toute confiance :

  • Échelle transformatrice : rapidité et flexibilité sans précédent grâce à la plateforme AXELIOS 1†.
  • Préparation efficace des échantillons : préparation de bibliothèques KAPA haute performance et solutions d’enrichissement des cibles.
  • Automatisation autonome : des années d’expertise pré-analytique avec le système AVENIO Edge*.
  • Indicateurs de performance : profilage génomique complet et fiable grâce aux tests AVENIO Tumor Tissue CGP.

Roche propose une gamme complète de solutions de NGS pour répondre à vos besoins en matière de recherche, quelle que soit la taille de votre cohorte d’échantillons ou des régions génomiques d’intérêt. 

Basée sur la technologie innovante de séquençage par expansion (SBX) de Roche, la plateforme AXELIOS 1 est une plateforme de séquençage très flexible à des fins de recherche uniquement (RUO) qui permet un séquençage précis et rentable pour un large éventail d’applications de recherche à une échelle et une rapidité sans précédent.

Nos solutions polyvalentes et hautes performances de préparation de bibliothèques KAPA permettent une grande variété d’applications de recherche, y compris le séquençage du génome entier (WGS), le séquençage de l’exome entier (WES), le séquençage du transcriptome entier (WTS) et le profilage de la méthylation. Le séquençage ciblé de l’ADN et de l’ARN est pris en charge par des panels d’enrichissement des cibles KAPA et des produits chimiques personnalisés, conçus par des experts. En outre, la recherche en oncologie est rendue possible par des tests de profilage génomique complet (PGC) et des tests oncologiques intégrés et entièrement optimisés de l’AVENIO. Notre système AVENIO Edge* entièrement autonome apporte aux laboratoires de NGS des années d’expérience en automatisation pré-analytique de Roche.

Nous permettons une analyse précise des données pour nos tests CGP et oncologiques grâce à des solutions logicielles intuitives basées sur le cloud, telles que la plateforme FoundationOne® Analysis et le logiciel AVENIO Oncology Analysis. L’analyse secondaire et la visualisation des données d’enrichissement des cibles générées avec les panels KAPA sont proposées par le biais de partenariats tiers. Les définitions de variants à haute confiance sont facilement converties en informations biologiques exploitables et en rapports compréhensibles avec notre navify® Mutation Profiler** ou une plateforme d’analyse tierce de votre choix.

Grâce à son expertise éprouvée et à ses solutions de séquençage innovantes, Roche soutient chaque étape de votre flux de travail de NGS, vous permettant de découvrir, de comprendre et d’agir en toute confiance.

Valeur

Des produits fiables et haute performance conçus pour répondre à vos besoins

Roche Diagnostics s’appuie sur une longue tradition d’innovation et d’expertise scientifique dans les domaines de la biologie moléculaire, de la pathologie, du laboratoire central et des soins aux patients. Nos solutions de séquençage complètent ce portefeuille, offrant des performances exceptionnelles et fiables et un flux de travail rationalisé.

Nos produits de séquençage, tels que la gamme KAPA de solutions de préparation de bibliothèques et d’enrichissement de cibles, l’AVENIO Edge System* et navify® Mutation Profiler** offrent la flexibilité nécessaire aux flux de travail de NGS, tandis que les tests AVENIO Tumor Tissue CGP et les tests oncologiques de bout en bout sont soigneusement optimisés pour une mise en œuvre facile dans les laboratoires ayant une expérience limitée en matière de NGS.

La plateforme transformatrice AXELIOS 1 est conçue pour fournir la précision et la vitesse nécessaires à un délai de traitement rapide et à une couverture approfondie qui peuvent soutenir les applications de recherche, tout en offrant la flexibilité et la rentabilité nécessaires pour soutenir les applications de recherche émergentes exigeantes en données telles que la génomique monocellulaire et la transcriptomique spatiale.

La conception de nos produits repose sur une vaste expérience du développement de produits, des collaborations scientifiques et une compréhension approfondie des opérations de laboratoire. Les informations obtenues en servant une clientèle mondiale diversifiée garantissent que les produits sont conçus pour répondre à des besoins spécifiques dans un large éventail de types d’échantillons, d’applications et de contextes de laboratoire. Les installations de fabrication de pointe sur plusieurs continents libèrent les produits selon des normes de qualité rigoureuses, garantissant ainsi une chaîne d’approvisionnement robuste et fiable.

Vision

Construire un avenir innovant, accessible et durable pour la médecine génomique

Chez Roche, nous combinons des décennies d’expertise dans le domaine du diagnostic et du développement de médicaments pour faire sans cesse progresser la science et relever les défis les plus complexes des soins de santé. Nous reconnaissons le NGS comme une technologie essentielle qui a le potentiel d’étoffer notre portefeuille de diagnostics, nous permettant de poursuivre notre mission consistant à améliorer la qualité de vie grâce à des solutions innovantes.

L’ajout de la technologie SBX à notre portefeuille contribue à concrétiser notre engagement à transformer le paysage du séquençage. Avec une précision, une rapidité, une évolutivité et une flexibilité élevées, SBX promet de révolutionner l’application de la recherche par NGS en oncologie, en génétique, dans les maladies complexes et infectieuses. Au fil du temps, nous intégrerons SBX à nos outils existants et à nos produits chimiques de pointe. Notre objectif est d’offrir toute l’étendue et la profondeur de l’expertise technique de Roche, une qualité constante des produits, une fiabilité et une assistance centrées sur le client, dans l’ensemble du flux de travail de séquençage, de l’échantillon au rapport.

Nous nous engageons à innover dans le domaine du NGS, en tirant parti de notre portefeuille pour proposer des solutions de bout en bout capables d’accélérer les applications dans la recherche, le diagnostic, la découverte et le développement de médicaments, les diagnostics compagnons et d’autres domaines à l’avenir. Notre objectif est de continuer à développer des soins de santé personnalisés, à la fois au sein de Roche et également via des partenariats avec des laboratoires de séquençage et des entreprises pharmaceutiques de premier plan dans le monde entier.

Préparez des banques de qualité élevée pour un séquençage de nouvelle génération efficace.

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Enrichissement efficace des cibles NGS avec les flux de travail KAPA HyperCap et KAPA HyperPETE de Roche, des solutions flexibles pour des panels ciblés ou larges et des conceptions personnalisées.

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Optimisez la qualité des banques et les ressources de votre laboratoire grâce à la préparation automatisée des échantillons.

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Tirez parti de la puissance du diagnostic moléculaire pour une oncologie de précision.

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Libérer la découverte génomique grâce à des solutions complètes prenant en charge une variété d’applications et de flux de travail de NGS.

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Préparer l’avenir du NGS avec la technologie de séquençage par expansion (SBX).

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Avantages des solutions de séquençage de Roche

Performance

Des solutions fiables et hautement performantes : des informations génomiques fiables

Les performances analytiques sont un facteur clé dans le développement et l’amélioration continue des solutions de séquençage de Roche.

  • La préparation de bibliothèques KAPA, les réactifs d’enrichissement des cibles et les tests AVENIO sont soigneusement optimisés pour atténuer la perte d’échantillons, limiter les biais et maximiser l’uniformité et la profondeur de la couverture du séquençage. Cela garantit la sensibilité et la spécificité nécessaires pour découvrir, caractériser et confirmer les variations génétiques en toute confiance, à partir de types d’échantillons de routine et difficiles.
  • L’AVENIO Edge System autonome* et les solutions d’automatisation tierces produisent des bibliothèques NGS de qualité similaire ou supérieure à celles préparées manuellement.1
  • La plateforme AXELIOS 1, optimisée par une technologie de séquençage SBX innovante, est conçue pour fournir une précision de lecture brute destinée à répondre aux exigences des applications de recherche les plus strictes.2
  • Les outils d’analyse de données secondaires et tertiaires développés par Roche, tels que les outils d’analyse à source ouverte optimisée SBX (XOOS), la plateforme FoundationOne® Analysis et navify®  Mutation Profiler**, sont méticuleusement développés et organisés pour garantir des définitions de variants précises et fiables et des informations exploitables.
Flexibilité

Solutions adaptables : répondre aux divers besoins de vos applications

Notre gamme de produits NGS offre des configurations de produits et des paramètres de flux de travail flexibles pour prendre en charge l’échelle de votre projet, les complexités de votre conception expérimentale et les exigences ou contraintes opérationnelles.

  • La plateforme AXELIOS 1 vise à offrir une flexibilité opérationnelle unique, des longueurs de lecture sélectionnables et des temps d’exécution de séquençage accélérés qui s’échelonnent proportionnellement à la sortie.
  • La préparation de bibliothèque KAPA et les réactifs d’enrichissement des cibles sont disponibles dans une variété de configurations de produits et de tailles d’emballage pour prendre en charge la préparation manuelle et automatisée des échantillons, minimiser les déchets plastiques et réduire le coût par échantillon. Du contenu, un emballage et une documentation personnalisés sont disponibles pour soutenir les objectifs de votre projet et vos opérations commerciales.
  • Les solutions AVENIO Edge System* et tierces de préparation automatisée des échantillons offrent des paramètres réglables pour prendre en charge différentes tailles de lots, longueurs de fragments et autres paramètres de flux de travail.
  • Les tests oncologiques AVENIO offrent un cadre polyvalent pour l’analyse des tissus tumoraux et de l’ADNtc, soutenant les applications de recherche, du profilage génomique par carte au profilage ciblé avec diverses tailles de panels.
Efficacité

Conçu pour l’efficacité : accélérez votre parcours de l’échantillon à la connaissance

Si la puissance du NGS excelle dans l’analyse de questions biologiques complexes, cela s’accompagne souvent d’un compromis en termes de délai d’exécution par rapport aux tests non NGS. Chez Roche, nous nous efforçons continuellement de réduire le temps écoulé entre l’échantillon et le résultat en rationalisant notre technologie, nos flux de travail, notre chimie et nos algorithmes d’analyse.

  • La technologie SBX permet une efficacité élevée avec plusieurs méthodes de séquençage et des longueurs de lecture sélectionnables sur une seule plateforme, des modules de capteur réutilisables et des temps d’exécution accélérés. Dans une expérience de démonstration de concept, le flux de travail SBX-Fast permet de terminer une série de séquençage de l’ADN de l’échantillon au VCF en environ 5 heures.
  • Les flux de travail KAPA et AVENIO, manuels ou automatisés, sont continuellement affinés pour minimiser les ajouts de réactifs, les manipulations et les temps d’incubation, en s’assurant que l’intervention de l’utilisateur est réduite sans compromettre les performances.
  • Les flux de travail sont conçus et optimisés pour les jours de travail standard. Ils intègrent un contrôle qualité (CQ) et des points d’arrêt sûrs pour favoriser des taux de réussite élevés et une utilisation optimale des ressources de laboratoire.
  • Les outils d’analyse secondaire et tertiaire sont basés sur le cloud et intuitifs à utiliser.
Qualité

Un excellence sans faille : la promesse de qualité de Roche

Les normes de qualité de Roche englobent un engagement en faveur d’une conduite éthique, de la sécurité des patients, de la protection de l’environnement et de performances élevées dans l’ensemble de ses opérations mondiales. 

  • Nous gérons la qualité par le biais d’un système de management de la qualité (SMQ) mondial robuste qui garantit la conformité avec des politiques et des normes internes strictes, ainsi qu’avec des directives et des réglementations externes.
  • Nous nous engageons à nous améliorer continuellement et à mettre en place une culture de la conformité afin de garantir l’intégrité et la durabilité de la chaîne d’approvisionnement.
  • Les processus et les indicateurs de qualité sont développés et validés pendant le développement du produit. Chaque instrument et lot de réactifs fait l’objet d’un contrôle qualité (CQ) rigoureux afin de garantir des performances fiables et une cohérence d’un lot à l’autre. 
Graphique radial bleu avec des motifs ATCG à évolution rapide symbolisant l’analyse génomique à grande vitesse pour la plateforme Sequencing by Expansion SBX

Plateforme de séquençage de nouvelle génération

La plateforme de NGS de Roche utilise la nouvelle technologie exclusive de séquençage par expansion (SBX), conçue pour offrir une polyvalence, une cadence et une précision élevées.

Contact us

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Sujets de santé connexes

Les tests AVENIO et les produits KAPA sont réservés à la recherche. Ne pas utiliser à des fins diagnostiques.

*Le système AVENIO Edge est un dispositif médical de diagnostic in vitro (DIV) de classe 1 aux États-Unis et de classe A dans l’Union européenne (selon le RDIV). Il est destiné à des applications diagnostiques en aval. Dans l’Union européenne, Roche s’associe à Platomics pour offrir aux laboratoires la possibilité d’automatiser la génération de documents sur la plateforme multipartite Platomics pour les flux de travail intégrant le système AVENIO Edge. Les réactifs et les kits mentionnés sont destinés exclusivement à la recherche. Ils ne sont pas destinés à un usage diagnostique. Le système AVENIO Edge peut être utilisé pour des workflows destinés exclusivement à la recherche (Research Use Only, RUO).

**navify® Mutation Profiler porte le marquage CE-DIV dans l’UE. Ce produit est destiné exclusivement à la recherche et ne doit pas être utilisé dans le cadre de procédures diagnostiques aux États-Unis et dans d’autres pays lorsqu’il est utilisé avec les trousses AVENIO Tumor Tissue CGP. L’analyse tertiaire avec navify® Mutation Profiler ne fait pas partie de la trousse de tests automatisés AVENIO Tumor Tissue CGP et peut être achetée en complément.

†La plateforme de séquençage AXELIOS 1 et la technologie de séquençage par expansion (SBX) sont en cours de développement et ne sont pas disponibles sur le marché. Le contenu du présent document est le reflet des résultats actuels de l’étude clinique et/ou les objectifs de conception. La plateforme de séquençage AXELIOS 1, basée sur la technologie SBX, sera lancée à des fins de recherche uniquement (RUO). Ne pas utiliser à des fins diagnostiques.

 

Sauf indication contraire, toutes les informations sont des données internes de Roche.

Références

  1. Kokoris M, et al. Sequencing by Expansion (SBX) – a novel, high-throughput single-molecule sequencing technology. bioRxiv. 2025 Mar 15. doi: https://doi.org/10.1101/2025.02.19.639056.