Accessoires pour la préparation d’échantillons de qualité élevée pour des tests NGS hautes performances
Tous les flux de travail de préparation des banques NGS, qu’il s’agisse d’ADN ou d’ARN, nécessitent de nombreuses étapes, notamment l’ajout de séquences d’adaptateurs spécifiques au séquenceur et au moins une étape de purification à base de billes. Les flux de travail NGS enrichis par cible nécessitent des accessoires NGS supplémentaires tels que des oligos (sondes et amorces), des réactifs d’amplification, des billes de capture et des réactifs de lavage.
La qualité de ces accessoires NGS est primordiale, même lorsque l’on commence avec les réactifs de la qualité la plus élevée contenus dans la trousse de construction de la banque de base. Par exemple, des indices d’adaptateur incorrects ou des étapes à base de billes peu efficaces peuvent entraîner la perte d’échantillons précieux, voire l’échec de l’ensemble des séquences.
La gamme de produits Roche pour la préparation de bibliothèques et l’enrichissement des cibles, leader du secteur, offre tous les accessoires NGS nécessaires à la préparation des échantillons pour la préparation des banques. Nos réactifs sont soigneusement validés afin de garantir des performances optimales et sont fournis sous forme de trousses autonomes dans différentes configurations d’emballage afin de favoriser la flexibilité et l’automatisation.
Produits vedettes
Avantages des accessoires NGS de Roche pour la préparation des échantillons
Accessoires de préparation d’échantillons pour tous les flux de travail de préparation de banques de Roche
Nous fournissons tous les accessoires nécessaires à la préparation des échantillons pour chacun de nos flux de travail de construction de banques d’ADN et d’ARN, y compris les sondes d’enrichissement des cibles, les amorces et les accessoires. La gamme complète comprend :
- Adaptateurs pour la préparation de banques d’ADN et d’ARN : adaptateurs KAPA UDI pleine longueur (96 adaptateurs avec index doubles uniques UDI inclus) ; adaptateur universel KAPA ou adaptateur universel KAPA UMI (à utiliser en combinaison avec les mélanges d’amorces KAPA UDI 1-384, qui ajoutent les séquences d’index) ; tampon de dilution d’adaptateur KAPA.
- Billes pour la préparation et le nettoyage des banques : billes KAPA HyperPure et KAPA Pure.
- Réactifs de capture pour l’enrichissement de cibles par hybridation : sondes KAPA HyperCap, trousses de réactifs KAPA HyperCapture, trousses de billes KAPA HyperCapture, tampon de remise en suspension des sondes KAPA, oligos universels d’optimisation (UEO) KAPA et réactif amplificateur d’hybridation KAPA.
- Réactifs pour l’enrichissement des cibles d’extension d’amorce : trousse de réactifs KAPA HyperPETE.
Chaque réactif a été validé pour tous les flux de travail de préparation d’échantillons Roche
Bien que tous les fournisseurs soumettent leurs réactifs à des tests de contrôle qualité (CQ), ils ne valident pas tous chaque réactif dans leurs flux de travail ou n’utilisent pas tous de CQ basé sur le NGS. Tous nos réactifs accessoires NGS sont validés dans les flux de travail de préparation des échantillons et d’enrichissement des cibles de Roche pour garantir la précision des index, des rendements optimisés et des taux de réussite élevés pour tous les types d’échantillons et toutes les applications.
- Les adaptateurs sont soumis à des tests de contrôle qualité basés sur le séquençage afin de confirmer leurs séquences de codes-barres et minimiser le risque d’attribution erronée d’index résultant d’une contamination croisée des codes-barres
- Tous les lots d’adaptateurs et de billes sont soigneusement validés afin de garantir des rendements et des performances optimaux
Large gamme de configurations de trousses pour plus de flexibilité et d’automatisation
Le type et la quantité d’adaptateurs et de billes nécessaires à un flux de travail de préparation de banque peuvent varier considérablement, en fonction du matériel d’entrée, de la longueur des fragments (exigences en matière de sélection de la taille), de la stratégie d’enrichissement des cibles (le cas échéant), du niveau de multiplexage et de l’application de séquençage. Afin de soutenir au mieux l’ensemble de notre gamme de flux de travail de construction de banques d’ADN et d’ARN et d’enrichissement des cibles, les accessoires NGS pour la préparation d’échantillons sont disponibles sous forme de trousses autonomes dans divers formats.
- Les options d’adaptateurs comprennent des adaptateurs universels tronqués avec ou sans identificateurs moléculaires uniques (UMI) ou des adaptateurs pleine longueur à double indexation unique (UDI)
- Les emballages sont disponibles en plusieurs formats afin de s’adapter à différents types d’entrées, stratégies de multiplexage et applications, tout en garantissant un gaspillage minimal
- Les formats de réactifs comprennent des tubes ou des réactifs en plaques adaptés à l’automatisation, ainsi que des formats en vrac sous forme de billes.
* Les ensembles de 192 et 768 séquences de codes-barres utilisés dans les adaptateurs KAPA UDI et les mélanges d’amorces KAPA UDI (respectivement) sont exclusifs à Roche et différents entre les deux ensembles. Tous les codes-barres sont compatibles avec tous les instruments Illumina à cellules de flux avec ou sans motifs. Veuillez noter que les adaptateurs KAPA ne sont pas compatibles avec les applications methyl-seq.
** Suffisant pour quatre préparations de banques (plaque d’adaptateurs KAPA UDI ou plaque de mélanges d’amorces KAPA UDI, respectivement) avec les trousses KAPA EvoPrep ou KAPA EvoPlus V2 si aucune dilution d’adaptateur n’est nécessaire. Le surremplissage généreux permet une utilisation sur des systèmes automatisés de traitement des liquides.
† Les mélanges d’amorces KAPA UDI Primer Mixes et les plaques d’adaptateur KAPA sont expédiés avec des joints décollables. Les joints de rechange (trois par plaque) sont décollables et perforables.
Les produits KAPA sont réservés à la recherche. Ne pas utiliser dans les procédures de diagnostic.