Desde que empezó la pandemia Roche ha hecho un gran esfuerzo en desarrollar productos para poder diagnosticar al virus responsable de la COVID-19, el SARS-CoV-2, por lo que ha diseñado test robustos para su diagnóstico, por ejemplo, doble diana. Además, la empresa está haciendo un seguimiento cercano de las posibles variaciones del virus para testar los kits y ver si es necesario hacer actualizaciones.
Por ello, recientemente se ha detectado un grupo filogenético distinto (llamado linaje B.1.1.7) en el conjunto de datos de vigilancia del COG-UK y Roche ha analizado las secuencias de las variantes D614G y N501Y del virus de Reino Unido y las ha comparado con el diseño de las pruebas moleculares que disponemos, concluyendo que estas mutaciones no afectarán a los kits cobas SARS-CoV-2 y cobas SARS-CoV-2&InfluenzaA/B
Así, desde que empezó la pandemia se ha evaluado de forma continua si los test de Roche detectarán las secuencias del SARS-CoV-2 presentes en las bases de datos del NCBI(>46K) y del GISAID (>268), hasta diciembre de 2020.
Al estar diseñados con doble diana y no haberse identificado secuencias que presenten mutaciones en las regiones diana, es de prever que no exista impacto en ninguno de los test cobas®:
- cobas® SARS- CoV-2 & Influenza A/B Tests for use on the cobas® 6800/8800 Systems
- cobas® SARS- CoV-2 & Influenza A/B Test for use on the cobas® Liat® System
- LightMix® Modular SARS- CoV-2 assays
En paralelo, Roche ha analizado el impacto de la variante en el portfolio de Roche Centralized y Point of Care para el SARS-CoV-2, y basado en dicho análisis, anticipa que dicha variante no impacta en estos test:
- Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 Test,
- Elecsys® SARS-CoV-2 Antigen Test
- Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S Test.
- SARS-CoV-2 Rapid Antibody Test
- SARS-CoV-2 Rapid Antigen Test
Adicionalmente, nuestras soluciones para la secuenciación del virus por NGS también son capaces de detectar esta nueva variante.
Por un lado, nuestro reactivo DeepChek 8-plex CoV-2 genotyping assay es un Ensayo de NGS dirigido a 8 regiones genómicas del virus de alta diversidad. El kit cubre 8 de las 17 mutaciones que provocan el linaje B.1.1.7, permitiendo así la identificación de muestras pertenecientes a esta variante.
Otra de nuestras soluciones está basa en nuestros paneles de KAPA Target Enrichment. El panel diseñado para SARS-CoV2 cubre 184 secuencias para el SARS-CoV2 del NCBI y cubre el 100% del genoma de referencia.
En este caso, al secuenciar el genoma completo del virus, se pueden detectar las modificaciones que dan lugar al nuevo linaje B.1.1.7, permitiendo así la identificación de muestras pertenecientes a esta variante.
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