Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S*

Иммуноанализ для количественного определения антител к S-белку SARS-CoV-2

Elecsys pack
Иммуноанализ для количественного определения антител к S-белку SARS-CoV-2

Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S представляет собой иммуноанализ для in vitro диагностики, предназначенный для количественного определения антител (включая IgG) к рецептор-связывающему домену (RBD) шиповидного (S) белка SARS-CoV-2 в сыворотке и плазме крови человека. В дизайне теста используются рекомбинантные специфичные антигены SARS‑CoV‑2, представляющие собой рецептор-связывающий домен (RBD) S‑белка, которые образуют сэндвич-комплекс для обнаружения высокоаффинных антител к SARS‑CoV‑2. Тест предназначен для оценки адаптивного гуморального иммунного ответа на S-белок SARS-CoV-231

Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S

Общая информация

 

SARS-CoV-2, возбудитель коронавирусной инфекции 2019 года (COVID-19), представляет собой оболочечный вирус, содержащий одноцепочечную РНК, который относится к роду бета-коронавирусы. Идентифицировано семь коронавирусов, вызывающих инфекционные заболевания у человека, проявления которых могут варьироваться от симптомов легкой ОРВИ до тяжелой дыхательной недостаточности1

SARS-CoV-2 передается от человека к человеку преимущественно воздушно-капельным путем2,3. Инкубационный период от инфицирования хозяина до обнаруживаемой вирусной нагрузки обычно составляет от 2 до 14 дней4,5. Обнаружение вирусной нагрузки может сопровождаться появлением клинических симптомов, хотя у значительной части инфицированных лиц симптомы отсутствуют или слабо выражены6–8. Период, в течение которого человек с COVID-19 является заразным, до сих пор четко не установлен, однако описана передача вируса от людей с симптомами, без симптомов и до появления симптомов9–11.

 

Геном коронавирусов кодирует 4 основных структурных белка: шиповидный белок (S), белок оболочки (E), мембранный белок (M) и нуклеокапсидный белок (N).

S-белок представляет собой очень большой трансмембранный белок, который собирается в тримеры, образующие характерные шипы на поверхности коронавирусов. Каждый мономер S-белка состоит из N-терминальной субъединицы  S1 и мембранно-проксимальной субъединицы  S2. Вирус проникает в клетку-хозяина путем связывания S-белка с играющим роль рецептора ангиотензин-превращающим ферментом  2 (АПФ2), который присутствует на поверхности клеток многих типов, включая альвеолоциты II типа в легких и эпителиальные клетки слизистой оболочки ротовой полости12,13. Механистически АПФ2 взаимодействует с рецептор-связывающим доменом (RBD) субъединицы S114,15.

При инфицировании SARS-CoV-2 в организме хозяина обычно возникает иммунный ответ против вируса, включающий образование специфичных антител к антигенам вируса. Антитела класса IgM и IgG к SARS-CoV-2 появляются в крови практически одновременно16. У пациентов с COVID-19 наблюдаются значительные индивидуальные различия в отношении уровней и последовательности появления антител, однако медиана времени до сероконверсии составляет около двух недель17–20.

Структура шиповидного (S) белка SARS-CoV-2 и его связывание с рецептором клетки-хозяина

Illustration of the structure of the spike protein

Клиническая чувствительность31

Отобразить всю таблицу

Клиническая чувствительность31

С использованием теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S было проанализировано 1610 образцов, отобранных у 402 пациентов с клиническими симптомами (включая 297 образцов, отобранных у 243 госпитализированных пациентов), у которых инфицирование SARS-CoV-2 было подтверждено методом ПЦР. У этих пациентов было отобрано по одному или несколько последовательных образцов в разных временных точках после подтверждения диагноза методом ПЦР. Через 14 или более дней после диагностики методом ПЦР были отобраны 1423 образца. Из этих 1423 образцов результаты теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S составляли ≥0,8 Е/мл для 1406 образцов, которые были признаны положительными, таким образом, в этой когорте образцов чувствительность составила 98,8% (95% ДИ*: 98,1 – 99,3%).

С использованием теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S было проанализировано 1610 образцов, отобранных у 402 пациентов с клиническими симптомами (включая 297 образцов, отобранных у 243 госпитализированных пациентов), у которых инфицирование SARS-CoV-2 было подтверждено методом ПЦР. У этих пациентов было отобрано по одному или несколько последовательных образцов в разных временных точках после подтверждения диагноза методом ПЦР. Через 14 или более дней после диагностики методом ПЦР были отобраны 1423 образца. Из этих 1423 образцов результаты теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S составляли ≥0,8 Е/мл для 1406 образцов, которые были признаны положительными, таким образом, в этой когорте образцов чувствительность составила 98,8% (95% ДИ*: 98,1 – 99,3%).

 

Дни после подтверждения  методом ПЦР N Нереактивные образцы Чувствительность (95 % ДИ*)
0-6 дней 35 4 88.6 % (73.3 – 96.8 %)
7-13 дней 152 22 85.5 % (78.9 – 90.7 %)
14-20 дней 130 14 89.2 % (82.6 – 94.0 %)
21-27 дней 176 3 98.3 % (95.1 – 99.7 %)
28-34 дней 197 0 100 % (98.1 – 100 %)
≥35 дней 920 0 100 % (99.6 – 100 %)
* доверительный интервал
Graph Days post PCR confirmation

Аналитическая специфичность 31

Отобразить всю таблицу

Аналитическая специфичность 31

С использованием теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S было проанализировано 1100 образцов с потенциальной перекрестной реактивностью, которые были отобраны до октября 2019 года, включая образцы, положительные по антителам к MERS-CoV, образцы, отобранные у пациентов с симптомами ОРВИ, и образцы, которые были отобраны у лиц, инфицированных одним из четырех коронавирусов, вызывающих ОРВИ. Общая специфичность в этой когорте образцов с потенциальной перекрестной реактивностью составила 100 % (95 % CI: 99.7 – 100 %).

С использованием теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S было проанализировано 1100 образцов с потенциальной перекрестной реактивностью, которые были отобраны до октября 2019 года, включая образцы, положительные по антителам к MERS-CoV, образцы, отобранные у пациентов с симптомами ОРВИ, и образцы, которые были отобраны у лиц, инфицированных одним из четырех коронавирусов, вызывающих ОРВИ. Общая специфичность в этой когорте образцов с потенциальной перекрестной реактивностью составила 100 % (95 % CI: 99.7 – 100 %).

Когорта N Реактивные образцы  Специфичность(95% ДИ)
MERS-CoV* 7 0 100 % (59.0 – 100 %)
Панель ОРВИ** 21 0 100 % (83.4 – 100 %)
Панель коронавирусов*** 94 0 100 % (96.2 – 100 %)
Другие образцы с потенциальной перекрестной реактивностью****   978 0 100 % (99.6 – 100 %)
Итого 1.100   0 100 % (99.7 – 100 %)  
* Образцы, положительные по антителам класса IgG к субъединице S1 шиповидного белка коронавируса, вызывающего ближневосточный респираторный синдром (MERS-CoV) ** 40 образцов, отобранных у пациентов с симптомами ОРВИ до октября 2019 года *** Образцы, отобранные у лиц, ранее инфицированных коронавирусами HKU1, NL63, 229E или OC43, что было подтверждено тестированием на антигены **** Образцы, отобранные до пандемии по другим показаниям, при анализе которых вероятность неспецифической интерференции могла оказаться повышенной

Клиническая специфичность 31

Отобразить всю таблицу

Клиническая специфичность 31

С использованием теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S был проанализирован 5991 образец, отобранный с целью рутинной диагностики и у доноров крови до октября 2019 года. Общая специфичность в этой когорте образцов, отобранных до пандемии, составил 99.98 % (95 % CI: 99.91 – 100 %).

С использованием теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S был проанализирован 5991 образец, отобранный с целью рутинной диагностики и у доноров крови до октября 2019 года. Общая специфичность в этой когорте образцов, отобранных до пандемии, составил 99.98 % (95 % CI: 99.91 – 100 %).

Когорта N Реактивные образцы Специфичность (95 % ДИ) 
Рутинная диагностика 2,528  0 100 % (99.85 – 100 %)
Доноры крови из США 2,713 1 99.96 % (99.79 – 100 %)
Доноры крови из Африки 750 0 100 % (99.51 – 100 %)
Итого 5,991 1 99.98 % (99.91 – 100 %) 

Корреляция с нейтрализующей способностью сыворотки 31

Отобразить всю таблицу

Корреляция с нейтрализующей способностью сыворотки 31

Тест Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S был сопоставлен с тестом на нейтрализацию псевдовируса, полученного на основе вируса везикулярного стоматита32, с использованием 15 клинических образцов, отобранных у отдельных пациентов.

Тест Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S был сопоставлен с тестом на нейтрализацию псевдовируса, полученного на основе вируса везикулярного стоматита32, с использованием 15 клинических образцов, отобранных у отдельных пациентов.

       Нейтрализация псевдовируса   
  Положительный Неопределённый Отрицательный Итого
Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S ≥0.8 Е/мл 12 0 0 12
<0.8 Е/мл 1 1 1 3
Итого 13 1 1 15
Доля совпадающих положительных результатов 92.3 % (95 % CI 63.97 – 99.81 %)
Предполагаемая динамика маркеров при инфицировании SARS-CoV-233

Ccылки

 

* Реагенты в кассете для количественного определения общих антител IgM/IgG к SARS-CoV-2 иммунохемилюминесцентным методом в сыворотке и плазме крови на анализаторах  и модулях иммунохимических cobas e РУ РЗН 2020/13093 от 29.12.2020

** Набор калибраторов для количественного определения общих антител IgM/IgG  к SARS-CoV-2 в сыворотке и плазме крови иммунохемилюминесцентным методом на анализаторах и модулях иммунохимических cobas e РУ РЗН 2020/13090 от 28.12.2020

*** Набор контрольных сывороток для контроля качества определения общих антител IgM/IgG к  SARS-CoV-2 в сыворотке и плазме крови иммунохемилюминесцентным методом для анализаторов  и модулей иммунохимических cobas e РУ РЗН 2020/13089 от 28.12.2020

 

  1. Ye, Z.-W. (2020). Int J Biol Sci. 16(10), 1686-97.
  2. Word Health Organization (2020). Available from: https://www.who.int/news-room/commentaries/detail/transmission-of-sars-cov-2-implications-for-infection-prevention-precautions.
  3. Zhu, N. et al. (2020). N Engl J Med. 20, 382(8), 727-33.
  4. Chan, J.F.-W. et al. (2020). Lancet. 15, 395(10223), 514-23.
  5. Lauer, S.A. et al. (2020). Ann Intern Med. 172(9), 577-582.
  6. Zhou, R. et al. (2020). Int J Inf Dis. 96, 288-90.
  7. He, X. et al. (2020). Nat Med. 26(5), 672-5.
  8. Mizumoto, K. et al. (2020). Euro Surveill. 25(10), pii=2000180.
  9. Gao, M. et al. (2020). Respir Med. 169, 106026.
  10. Yu, P. et al. (2020). J Infect Dis. 221(11), 1757-61.
  11. Liu, Z. et al. (2020). Int J Inf Dis. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2020.06.036.
  12. Letko, M. et al. (2020). Nat Microbiol. 5(4), 562-9.
  13. Xu, H. et al. (2020). Int J Oral Sci. 24, 12(1), 1-5.
  14. Wrapp, D. et al. (2020). Science. 13, 367(6483), 1260-3.
  15. Hoffmann, M. et al. (2020). Cell. 16, 181(2), 271-280.e8.
  16. Centers for Disease Control and Prevention (2020). Available from: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/lab/resources/antibody-tests-guidelines.html.
  17. Long, Q. et al. (2020). medRxiv. https://doi.org/10.1101/2020.03.18.20038018.
  18. Lou, B. et al. (2020). Eur Respir J. 19, 2000763.
  19. Zhao, J. et al. Clin Infect Dis. ciaa344. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa344.
  20. Tuaillon, E. et al. (2020). J Inf. 81(2), e39-e45.
  21. Klasse, P.J. (2016). Expert Rev Vaccines 15(3), 295-311.
  22. Payne, S. (2017). Viruses: Chapter 6 – Immunity and Resistance to Viruses, Editor(s): Susan Payne, Academic Press, Pages 61-71, ISBN 9780128031094.
  23. Iwasaki, A. and Yang, Y. (2020). Nat Rev Immunol. https://doi.org/10.1038/s41577-020-0321-6.
  24. Salazar, E. et al. (2020). bioRxiv 2020.06.08.138990; https://doi.org/10.1101/2020.06.08.138990.
  25. Klasse, P. and Moore, J.P. (2020). Elife. 2020, 9:e57877. doi:10.7554/eLife.57877.
  26. Premkumar, L. et al. (2020). Sci Immunol. 11, 5(48).
  27. Luchsinger, L.L. et al. (2020). medRxiv. https://doi.org/10.1101/2020.06.08.20124792
  28. Mukherjee, R. (2020). J Biosci. 45, 68. https://doi.org/10.1007/s12038-020-00040-7.
  29. Graham, B.S. (2020). Science. 368(6494), 945-6.
  30. Hotez, P.J. et al. (2020). Nat Rev Immunol. 20(6), 347-8.
  31. Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S. Package Insert 2020-09, V1.0; Material Numbers 09289267190 and 09289275190.
  32. Meyer, B. et al. medRxiv. https://doi.org/10.1101/2020.05.02.20080879.
  33. Sethuraman, N. et al. (2020). JAMA. Published online May 06, 2020. doi:10.1001/jama.2020.8259.
  34. To, K. et al. (2020). Lancet Infect Dis. 20(5), 565-74.
  35. Xiang, F. et al. (2020). Clin Infect Dis. pii: ciaa46. https://doi.org/10.1093/cid/ciaa461.

Характеристики теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S

  • Время анализа

    18 минут

  • Принцип теста

    Одноэтапное образование сэндвич-комплекса с двумя антигенам

  • Прослеживаемость

    Внутренний стандартный образец Roche для антител к SARS-CoV-2-S, содержащий моноклональные антитела. 1 нM этих антител соответствует уровню антител 20 Е/мл, измеренному с помощью теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S

  • Диапазон линейности

    от 0.4 до 250 Е/мл

  • Калибровка

    2-точечная (отдельный набор CalSet)

  • Интерпретация

    <0,8 Е/мл = нереактивный, ≥0,8 Е/мл = реактивный

  • Типы образцов

    Сыворотка крови, полученная с использованием стандартных пробирок для отбора образцов;  плазма крови, содержащая Li-гепарин, K2-ЭДТА, K3-ЭДТА и натрия цитрат 

  • Объем образца

    20 мкл

  • Стабильность на борту

    14 дней

  • Корреляция с нейтрализующей способностью

    Результаты теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S высоко коррелируют с обнаружением нейтрализующих антител, доля совпадающих положительных результатов (PPA) составляет 99,19%

  • Корреляция с международным стандартным образцом ВОЗ

    Специфические единицы Е/мл теста Elecsys® Anti-SARS-CoV-2 S можно считать эквивалентными единицам BAU/мл первого международного стандартного образца ВОЗ для иммуноглобулина к SARS-CoV-2

  • Внутрилабораторная прецизионность для положительных образцов

    cobas e 411 analyzer: CV* 1.9 – 2.9 %
    cobas e 601 / cobas e 602 modules: CV 2.7 – 3.6