SBX（Sequencing by Expansion）テクノロジー

ロシュ シークエンシング ソリューションはゲノム科学における将来の大きなニーズに応えるべく邁進しています。中でもシークエンシングアプローチにおいては、より一層の速度向上、精度改善、拡張性強化、そして柔軟性向上が求められているものの、現在の技術に起因する制限や限界があり、これらの克服が必要であると認識しています。

DNAの塩基を測定するためにサイクルベースのアプローチを採用している従来のシークエンシング技術の場合、全てのシークエンシング反応が終了した後にはじめてデータへアクセスが可能となり、解析が開始できるようになります。単分子ナノポア技術を用いる別の市販されているシークエンシング技術の場合、この課題は解決されていますが、空間分解能の低さと核酸塩基の分子識別の低さに起因する、根本的なシグナルノイズ比の限界に課題があります

ロシュは、パフォーマンス向上の需要に応えるために、SBX（Sequencing by expansion）という新しいカテゴリーのNGS技術を開発しました。この強力なNGSアプローチは、柔軟性とパフォーマンスを重視し、将来的な拡張性も考慮して設計されています。具体的には、SBXには以下のような利点があります。
 

• 柔軟性：サンプルのニーズに合わせて使い方を柔軟に調整可能
• 精度：高い精度を実証（HG001 WGSのF1スコアが99.80%超（SNV）および99.7%超（InDel））
• スループット：非常に高いスループット（1時間のシークエンスで50億以上のduplex readsを取得。7ゲノムのWGSの場合平均30x以上）
• リード長：50bpから1000bp以上という柔軟なリード長
• 迅速ニーズ対応：緊急サンプル用の超高速ワークフロー オプション（サンプルから二次解析（VCF）まで5時間以内）
• コスト：拡張性があり再利用可能なセンサーモジュールによる高コスト効率を実現
  
  

SBXテクノロジーでは、DNA情報をより長い「拡張された」分子に変換することで、現在のナノポア技術の空間的課題を克服し、より高いシグナルノイズ比を実現し、精度を向上させます。この拡張された分子（エクスパンドマー）をロシュ独自のナノポアに通過させることで、驚異的な速度での単一分子シークエンシングが実現し、解析可能なシークエンシングデータへの迅速なアクセスも可能となります。