Effectuer la préparation de la banque ARN-seq avec efficacité et confiance
Traitez vos échantillons les plus complexes grâce à nos flux de travail complets et éprouvés, conçus pour traiter l’ARN FFPE fortement dégradé et les échantillons précieux à faible rendement. Les trousses KAPA RNA HyperPrep exploitent les enzymes issues de notre technologie d’évolution dirigée afin d’optimiser la conversion de l’ARN, offrant un biais GC minimal et une couverture exceptionnellement uniforme pour une quantification plus fiable.
- Accédez à des données fiables à partir d’ARN de faible qualité ou à faible rendement
- Optimisez la vitesse et la simplicité grâce à un flux de travail d’une journée sur un seul tube
- Adaptez les flux de travail à vos besoins, sans compromis
Le séquençage de l’ARN (RNA-seq) utilise le séquençage de nouvelle génération (NGS) pour établir un profil complet du transcriptome. Cette technique performante permet d’identifier les gènes exprimés de manière différentielle et leur abondance, et facilite la découverte de variants génétiques d’épissage, de nouveaux produits de transcription, de fusions géniques, d’isoformes et de variants nucléotidiques simples. En fonction du flux de travail sélectionné, les résultats peuvent inclure à la fois l’ARN codant et non codant, uniquement les produits de transcription polyA matures ou uniquement les ARN sélectionnés.
Lors de la préparation de la banque RNA-seq, les produits de transcription de l’ARN sont d’abord convertis en ADN complémentaire (ADNc), à l’aide de méthodes spécifiques à chaque brin qui améliorent la précision de la détection de l’ARN antisens et non codant, ainsi que la définition des limites des gènes. La préparation de la banque d’ARN peut également être associée à des méthodes permettant d’enrichir ou d’appauvrir sélectivement certains produits de transcription. Le séquençage de l’ARN offre donc des informations critiques sur le comportement et les réponses cellulaires dans divers états biologiques.
Produits vedettes
Avantages des solutions de préparation de banque d’ARN de Roche
Accédez à des données fiables à partir d’ARN de faible qualité ou à faible rendement
Le séquençage de l’ARN (RNA-seq) offre un aperçu puissant du transcriptome dynamique, révélant les détails complexes de l’expression et de la régulation des gènes qui définissent les états cellulaires en situation normale et pathologique1. Cependant, la construction d’une banque efficace à partir de l’ARN total nécessite une approche stratégique, car les échantillons sont généralement dominés par des espèces abondantes comme l’ARN ribosomique (ARNr) qui peuvent masquer la détection de produits de transcription plus pertinents.
Les trousses de préparation de banque d’ARN KAPA vous permettent d’obtenir des données reproductibles et de haute qualité à partir de vos échantillons les plus complexes. Nos solutions sont conçues pour traiter un large éventail de types d’échantillons, en tenant compte de diverses qualités et quantités de matériel d’entrée afin de vous permettre d’atteindre vos divers objectifs de recherche dans ces trois domaines clés :
- Séquençage du transcriptome entier : mesure des niveaux d’expression globaux de tous les produits de transcription codants et non codants, identification des exons, des introns et de leurs jonctions.
- Capture de l’ARNm : concentration sur les produits de transcription de l’ARNm afin de découvrir les bases moléculaires des différences phénotypiques et de quantifier les niveaux d’expression des gènes codants.
- Déplétion d’ARN : améliorer la sensibilité et la rentabilité en éliminant les ARN en abondance (tels que l’ARNr ou la globine). Cela permet une meilleure détection des produits de transcription rares, des modifications subtiles de l’expression génique ou l’atteinte d’objectifs expérimentaux avec moins de séquençage.
Optimisez la vitesse et la simplicité grâce à un flux de travail d’une journée sur un seul tube
Accélérez la préparation de banques RNA-seq, de l’échantillon à l’analyse, grâce à un flux de travail efficace. En combinant des préparations chimiques innovantes à des réactions enzymatiques optimisées, cette solution réduit considérablement la durée et la complexité des protocoles sans compromettre la qualité des données.
- Passez de l’ARN à une banque spécifique au brin en seulement quatre heures
- Réduisez le temps et la complexité du protocole avec moins d’étapes de purification
- Rationalisez votre flux de travail, de l’enrichissement de l’ARN à une banque prête à l’emploi pour Illumina en une seule journée
Adaptez les flux de travail à vos besoins, sans compromis
Obtenez des performances et une fiabilité supérieures, même lorsque vous travaillez avec des matériaux difficiles et en faible quantité ou de l’ARN dégradé provenant de tissus FFPE. Obtenez des résultats de haute qualité avec un flux de travail optimisé pour une sensibilité et une robustesse exceptionnelles.
- Transformez des échantillons difficiles à traiter en banques RNA-seq de haute qualité2
- Obtenez des résultats satisfaisants avec vos échantillons les plus complexes, qu’il s’agisse d’échantillons de types variés ou d’échantillons FFPETRNA dégradés, grâce à un flux de travail robuste1
Préparation de banques NGS conviviales pour l’automatisation
Vous envisagez d’automatiser la préparation de vos banques ? Roche propose une prise en charge de l’automatisation NGS grâce à un éventail de méthodes automatisées pour les réactifs de préparation de banques KAPA, compatibles avec les plateformes de traitement des liquides de fournisseurs tiers (hors Roche) et le système AVENIO Edge de Roche.
Les produits KAPA sont réservés à la recherche. Ne pas utiliser pour les procédures diagnostiques
Le système AVENIO Edge est un dispositif médical de diagnostic in vitro (DIV) de classe 1 aux États-Unis et de classe A dans l’Union européenne (selon le RDIV). Il est destiné à des applications diagnostiques en aval. Dans l’Union européenne, Roche s’associe à Platomics pour offrir aux laboratoires la possibilité d’automatiser la génération de documents sur la plateforme multipartite Platomics pour les flux de travail intégrant le système Avenio Edge. Les réactifs et les kits mentionnés sont destinés exclusivement à la recherche. Ils ne sont pas destinés aux procédures de diagnostic. Le système AVENIO Edge peut être utilisé pour des workflows destinés exclusivement à la recherche (RUO, Research Use Only).
Références
- Smail C and Montgomery SB. RNA sequencing in disease diagnosis. Annual Review of Genomics and Human Genetics. 2024;25:353–367. Disponible à l’adresse : https://www.annualreviews.org/content/journals/10.1146/annurev-genom-021623-121812
- Données internes de F. Hoffmann-La Roche Ltd.