Optimisez vos ressources de séquençage grâce à des panels d’enrichissement ciblés NGS personnalisés
Les panels NGS personnalisés vous permettent d’interroger un sous-ensemble sélectionné de régions génomiques à l’ampleur et à la profondeur requises par vos objectifs de recherche, sans gaspiller les lectures de séquençage sur d’autres régions. Cependant, sans les bons outils, la conception et la création de panels NGS personnalisés peuvent être décourageantes ; pire encore, des panels mal conçus peuvent gaspiller un temps précieux, des échantillons et d’autres ressources.
L’outil en ligne HyperDesign de Roche simplifie la conception de panels NGS personnalisés. HyperDesign simplifie la conception de panels et fournit des panels de sonde hautement performants sans avoir besoin d’une optimisation empirique approfondie. L’outil HyperDesign est :
- créé et soutenu par des experts en conception
- gratuit
- ergonomique
L’outil HyperDesign permet de concevoir des panels NGS personnalisés pour nos deux flux de travail d’enrichissement de cibles, avec des panels de sondes personnalisés pour notre flux de travail KAPA HyperCap et des amorces/sondes personnalisées pour notre flux de travail KAPA HyperPETE. Pour une flexibilité maximale, les panels pour génomes humains et non humains sont disponibles dans un large éventail de tailles de cibles et de formats de produits.
Produits vedettes
Avantages des solutions d’enrichissement des cibles NGS de Roche
Créer des conceptions de panels NGS réussies avec des algorithmes conçus par des experts
L’outil en ligne HyperDesign de Roche a été créé pour répondre aux défis posés par les autres outils de conception ; alors que beaucoup d’autres sont peu pratiques et difficiles à configurer, utilisent des algorithmes de conception mal optimisés ou ne bénéficient pas de l’assistance d’une personne en direct, l’outil HyperDesign est :
Un outil de conception de sonde en ligne convivial qui tire parti de deux décennies d’expérience de Roche en matière de conception de sonde in silico
Assistance par des concepteurs experts disponibles si vous avez besoin d’une aide supplémentaire
Piloté par des algorithmes de conception propriétaires qui permettent la couverture des régions riches en GC ou en AT, ainsi que d’autres régions complexes susceptibles de contenir des variants importants, sans augmenter significativement de manière significative les besoins en données de séquençage
L’outil HyperDesign peut également être utilisé pour personnaliser le contenu des panels KAPA HyperCap ou KAPA HyperPETE Design Share préconçus si du contenu supplémentaire est nécessaire pour satisfaire vos objectifs de recherche.*
Une conception optimisée associée à une fabrication minutieuse pour assurer la réussite du NGS
La conception des panels et la qualité des réactifs, y compris les sondes d’enrichissement des cibles, sont essentielles pour obtenir des mesures de performance optimales à partir de panels NGS personnalisés.
- Les panels NGS personnalisés conçus avec l’outil HyperDesign sont pré-optimisés pour les chimies d’enrichissement des cibles de Roche et conçus pour offrir une couverture uniforme et de faibles taux de duplication dès la première itération
- La fabrication de sondes à l’aide de l’ADN polymérase KAPA HiFi permet d’obtenir des sondes haute fidélité qui offrent des niveaux d’enrichissement très élevés
- Une fois que les panels NGS personnalisés ont été créés par Roche, ils sont soumis à des tests de contrôle qualité basés sur le NGS afin de confirmer la présence et la concentration des sondes/amorces avant d’être emballés et envoyés à votre laboratoire
La flexibilité est importante
Le séquençage ciblé personnalisé peut être compliqué si votre fournisseur NGS ne prend pas en charge l’organisme qui vous intéresse ou propose des formulations de produits limitées qui ne répondent pas aux exigences de votre projet. Roche propose différentes options d’enrichissement des cibles personnalisées :
Panels KAPA HyperCap Choice pour des conceptions humaines personnalisées, couvrant de 0,5 Mo à 200 Mo (tailles d’emballage de 12 à 100 000 réactions)*
Panels KAPA HyperCap Explore pour les génomes non humains et les conceptions humaines non conventionnelles, permettant un enrichissement jusqu’à 200 Mo (tailles d’emballage de 12 à 100 000 réactions)**
Panels KAPA HyperPETE Choice pour les conceptions humaines personnalisées (entrées d’ADN ou d’ARN) ; taille cible de 75 ko à 250 ko pour l’ADN et jusqu’à 50 ko pour l’ARN (tailles d’emballage de 96 à 10 000 réactions). Les panels KAPA HyperPETE Explore offrent des configurations de produits similaires pour les génomes non humains ou les conceptions humaines non conventionnelles.**
Comparaison des panels NGS personnalisés**
Afficher le tableau completComparaison des panels NGS personnalisés**
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Panels KAPA HyperCap Choice : |
Panels KAPA HyperCap Explore |
Panels KAPA HyperPETE Choice |
Panels KAPA HyperPETE Explore |
Génomes pris en charge |
Humain |
Conceptions humaines non humaines et non conventionnelles |
Humain |
Conceptions humaines, non humaines et non conventionnelles |
Tailles des cibles prises en charge |
0,5 à 200 Mo par incréments de taille maximale fixes |
0,5 à 200 Mo par incréments de taille maximale fixes |
75 - 250 ko (ADN) par incréments de taille maximale fixes 50 ko (ARN) |
75 - 250 ko (ADN) par incréments de taille maximale fixes 50 ko (ARN) |
Formats des packs disponibles |
12 à 100 000 rxn par incréments de réaction fixes |
12 à 100 000 rxn par incréments de réaction fixes |
96, 385, 1 536 ou 10 000 rxn |
96, 385, 1 536 ou 10 000 rxn |
Les produits KAPA sont réservés exclusivement à la recherche et non aux procédures diagnostiques.
* Tous les panels DesignShare ne sont pas actuellement disponibles ou pris en charge pour tous les flux de travail dans toutes les régions/tous les pays. Des restrictions s’appliquent à la personnalisation du contenu Design Share.
** Toutes les tailles d’objectif et toutes les tailles d’emballage ne sont pas disponibles dans toutes les régions/tous les pays.