Nos panels NGS conçus par des experts permettent un séquençage ciblé rapide et efficace
Dans de nombreux contextes de recherche biomédicale, le séquençage ciblé de nouvelle génération (NGS) offre plusieurs avantages par rapport au séquençage du génome entier (SGE). Par exemple, l’utilisation de panels NGS pour l’enrichissement de régions génomiques spécifiques peut :
- Réduire les coûts de séquençage tout en permettant un séquençage plus approfondi, car les régions d’intérêt spécifiques peuvent être examinées plus en détail pour une sensibilité accrue
- Simplifier à la fois l’analyse informatique et le stockage des données, car les panels NGS fournissent des données plus ciblées et moins de données provenant d’autres régions génomiques
Cependant, la conception des panneaux NGS peut être complexe et chronophage et nécessiter plusieurs cycles de conception et d’essais expérimentaux pour couvrir de manière suffisante et cohérente la région souhaitée. Pour faciliter la tâche aux chercheurs qui souhaitent se lancer dans le NGS ciblé sans concevoir de nouveaux panels, Roche propose des panels NGS préconçus pour nos deux flux de travail d’enrichissement des cibles NGS : le flux de travail KAPA HyperCap basé sur l’hybridation et le flux de travail KAPA HyperPETE, qui utilise l’enrichissement des cibles par extension d’amorce.
Nous proposons deux types de panels préconçus pour réduire les efforts et les dépenses nécessaires à la réalisation d’un NGS ciblé :
- Panels de catalogue : conçus par des chercheurs experts, validés en interne par des analyses et disponibles en stock
- Panels Design Share : développés en collaboration avec des scientifiques de renommée mondiale et personnalisables à l’aide de l’outil HyperDesign de Roche
Si vous souhaitez concevoir vos propres panels, l’outil en ligne HyperDesign est un outil de conception de panels NGS gratuit, facile à utiliser et flexible qui vous permet de créer vos propres panels à partir de zéro.
Produits vedettes
Avantages des solutions de panels NGS préconçues de Roche
Le séquençage hautement fiable est rendu possible grâce à des panels NGS conçus par des experts
La conception d’un nouveau panel de séquençage peut s’avérer complexe pour les chercheurs novices en matière de séquençage ciblé ou de flux de travail spécifique. Éliminez les approximations grâce aux panels NGS préconçus de Roche.
Nos panels sont conçus par des chercheurs experts qui exploitent un algorithme sophistiqué fondé sur plus d’une décennie d’expertise en conception de sondes. Chaque nouvelle sonde fait l’objet d’une conception et d’une optimisation rigoureuses in silico afin de répondre aux critères de performance clés du flux de travail prévu. Ce processus garantit que le contenu de notre panel NGS est pertinent, actuel et couvre de manière adéquate les régions génomiques ciblées présentant un intérêt particulier.
Conception robuste pour une couverture fiable des cibles dans des applications NGS ciblées
Si la conception du panel est essentielle pour garantir que tous les gènes/régions d’intérêt sont uniformément couverts, la qualité des sondes est tout aussi importante pour garantir des résultats de séquençage robustes et reproductibles.
Les panels de séquençage préconçus de Roche sont soumis à des tests approfondis, soit en interne chez Roche, soit par des collaborateurs externes. Cela garantit des taux de précision et des indicateurs de couverture élevés, ainsi qu’une détection précise et sensible des mutations.
Chaque lot de sondes du panel de catalogue est soumis à des tests de contrôle qualité (CQ) NGS afin de confirmer la présence et la concentration des sondes.
Les panels NGS préconçus et validés réduisent les délais de mise en œuvre et de commande
Le temps nécessaire pour concevoir, optimiser, valider et mettre en œuvre un nouveau panel NGS peut varier de quelques semaines à plusieurs mois, et la fabrication des sondes peut ajouter plusieurs jours, voire plusieurs semaines, au délai total si aucun panel existant n’est disponible dans le laboratoire.
En choisissant un panel préconçu ou un panel Design Share, le délai entre la conception du panel et sa mise en œuvre peut être considérablement réduit. Les panels du catalogue sont disponibles en stock. Par conséquent, les délais sont similaires à ceux des autres réactifs requis pour votre flux de travail KAPA HyperCap ou KAPA HyperPETE.
La prise en charge par un seul fournisseur de l’ensemble du flux de travail simplifie le processus de commande et la gestion des stocks.
* Les panels personnalisés et Design Share ne sont pas tous actuellement disponibles dans tous les pays/régions.
** Accessibles en ligne à l’adresse : https://www.hyperdesign.com
Les produits KAPA sont réservés exclusivement à la recherche et non aux procédures diagnostiques.