Proyectos de Colaboración

NUEVA METODOLOGÍA PARA LA DETECCIÓN DEL CÁNCER DE PRÓSTATA A TRAVÉS DE BIOMARCADORES NO INVASIVOS. ESTUDIO MULTICÉNTRICO PSA GLICOSILADO.

El proyecto PSA Glicosilado, tiene como objetivo desarrollar una herramienta de diagnóstico no invasiva al combinar la determinación analítica de bio-marcadores con pruebas de imagen como la Resonancia Magnética Multiparamétrica (MRI), para la mejora del diagnóstico y seguimiento del Cáncer de Próstata (CaP), con la finalidad de implementarla en la rutina clínica diaria, mejorando la calidad de vida de los pacientes. De este modo se espera aumentar la efectividad de los programas de cribado, reduciendo los costes adicionales producidos por la enfermedad.

El Cáncer de Próstata (CaP) es un problema de salud pública a gran escala, y la neoplasia maligna más común entre los hombres en países industrializados. La Organización Mundial de la Salud (OMS) publicó recientemente que el Cáncer de Próstata es el segundo tipo de cáncer más frecuentemente diagnosticado en hombres. El CaP representa el 7,1% de todos los cánceres diagnosticados y el 4% de todas las muertes debidas al cáncer. Aproximadamente, 107.000 muertes al año en Europa están asociadas con esta forma de cáncer y alrededor de 1 de cada 6 hombres se espera que sea diagnosticado de CaP durante su vida.

El presente proyecto propone una estrategia combinada de detección de una isoforma del PSA (PSA Glicosilado) con la Resonancia Magnética Multiparamétrica de la próstata, con lo que se puede mejorar mucho la eficacia diagnóstica del Cáncer de Próstata, evitando la realización de biopsias innecesarias. Esta herramienta conjunta permitirá disminuir de forma importante, tanto los problemas humanos como los costes sanitarios que derivan de la sobrediagnosis y sobretratamiento de esta tipología de cáncer, facilitando la detección del tumor prostático cuando exista y permitiendo valorar su agresividad. Los biomarcadores séricos, con un coste reducido, resultarán de gran utilidad tanto para realizar un cribado amplio y específico, como para llevar a cabo la vigilancia activa de la población susceptible de padecer o desarrollar un CaP agresivo.

El proyecto ha sido cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) a través del Programa Operativo Pluri-regional de Crecimiento Inteligente 2014-2020 y por el Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI), apoyado por el Ministerio de Economía y Competitividad (CDTI IDI-20170423).

IDI-20170423 “Nueva metodología para la detección del cáncer de próstata a través de bio- marcadores no invasivos. Estudio multicéntrico PSA glicosilado”.

Desarrollo de un sistema experto de soporte a la decisión en el uso de antimicrobianos. Net Antimicrobial Stewardship Program (NASP).

 La gestión de los antimicrobianos en los hospitales para evitar la aparición de resistencia es uno de los mayores retos de la actualidad. Esta resistencia generalmente, se ve facilitada por el uso inadecuado de los medicamentos. En muchos países, como el nuestro, son frecuentes las infecciones por bacterias sensibles a un solo antimicrobiano, y crecen los casos de infecciones causadas por bacterias pan-resistentes (PDR), es decir resistentes a todos los antimicrobianos conocidos, extremadamente resistentes (XDR), resistentes a casi todos los antimicrobianos disponibles, o multiresistentes (MDR), resistentes a varios antimicrobianos. La adecuada gestión del problema de la resistencia y, en particular, la gestión de las Infecciones Relacionadas con la Asistencia Sanitaria (IRAS), constituyen uno de los principales problemas de salud pública en los países desarrollados, tanto desde el punto de vista de la morbimortalidad, como por el impacto económico que suponen.

El principal objetivo científico-técnico del proyecto NASP es el desarrollo de un sistema de soporte a la decisión de estrategias para la optimización de uso de antimicrobianos (SsDPROA) y diseño de políticas locales de control de la resistencia, mediante la explotación en tiempo real de la información clínica y diagnóstica específica del entorno, el diseño de mapas epidemiológicos de la resistencia bacteriana y fúngica y la monitorización y cuantificación de la efectividad de las intervenciones sobre los niveles de resistencia y sensibilidad del entorno.

El proyecto, en colaboración con Hospital Universitario Virgen de Macarena (Sevilla) y RedResist, ha sido cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) a través del Programa Operativo de Crecimiento Inteligente 2014-2010 y por el Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI), apoyado por el Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (IDI-20181246)

Cuantificación secuencial de círculos de excisión del receptor de células T (TRECs) y círculos de excisión por recombinación del receptor de células B (KRECs) en receptores de trasplante alogénico de progenitores hematopoyéticos.

Los TRECs y KRECs son fragmentos episomales de ADN generados durante el reordenamiento de los genes VDJ en el Timo, en el caso de los Linfocitos T, y en la médula ósea, en el caso de los Linfocitos B.  Actualmente la detección de TRECs y KRECs se utiliza para el cribado neonatal de Inmunodeficiencia Combinada Grave (IDCG o SCID) a partir de muestras de sangre extraídas del talón del neonato. La detección se realiza a partir de qPCR (PCR a tiempo real) mediante cuantificación absoluta, utilizando un standard para determinar el valor de TREC y KREC. A partir de la experiencia en el diagnóstico de TRECs-KRECs en cribado neonatal, y debido a que estos parámetros tienen mucho que ver con el sistema inmune y su estado de competencia, hemos detectado una necesidad cuyo desarrollo tecnológico e implementación es totalmente plausible dentro del área de hematología.

Desde el punto de vista clínico, subyace el rol de la determinación de TRECs y KRECs en el alotrasplante como tal. Para ello se pretende valorar su utilidad en la detección, cuantificación y monitorización de la recuperación del sistema inmune tras el trasplante.  Con este fin, el proyecto analizará un total de 400 pacientes, 5 muestras seriadas de cada uno de ellos (pretrasplante, 1 mes, 3, 6 y 12 meses, respectivamente) hasta completar un total de 2000 muestras.

Por otro lado se pretende conseguir una estandarización del método de detección y cuantificación para el seguimiento de alotrasplantes ya que actualmente no existe un método analítico, en el mercado para esta nueva aplicación. En 2017 se realizaron en España más de 3300 alotrasplantes de médula ósea.

El proyecto, en colaboración con Hospital Universitario Puerta del Hierro (Madrid), ha sido cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) a través del Programa Operativo de Crecimiento Inteligente 2014-2010 y por el Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI), apoyado por el Ministerio de Economía y Competitividad (CDTI IDI-20180259).

Plataforma de Medicina de Precisión basada en el Desarrollo y Uso Asistencial de Aplicaciones y Tecnología de Next-Next Generation Sequencing (NNGS).

El objetivo principal del proyecto es desarrollar una metodología de diagnóstico de alto rendimiento basado en la secuenciación masiva de sistemas genómicos con alta variabilidad que tengan un interés clínico. El éxito en el desarrollo de esta metodología diagnóstica permitirá obtener varios productos con aplicación directa a la clínica y al manejo de pacientes. Los sistemas genómicos de alta variabilidad incluyen virus, bacterias y células tumorales. En todos estos casos, la identificación y clasificación correcta de las variantes permite la estratificación de los pacientes y el diseño del tratamiento personalizado que ofrezca la máxima probabilidad de curación.

De forma global, este proyecto se basa en el conocimiento de las necesidades del cuidado de la salud, la continua incorporación de avances dentro de la tecnología NNGS (Next Generation Sequencing) y el desarrollo específico de herramientas bioinformáticas que facilitan el análisis y la interpretación clínica de la enorme cantidad de datos obtenidos en la diagnosis por secuenciación. Con este objetivo se han dividido las aplicaciones de la nueva plataforma en dos grandes grupos: la diagnosis de agentes infecciosos de interés clínico (virus y bacterias) y diagnosis oncológica. Respecto a la parte relacionada con la oncología, las aplicaciones de diagnosis de la nueva plataforma se han separado en dos subgrupos: cáncer hereditario y cáncer no hereditario.

El proyecto, en colaboración con el Institut de Recerca del Vall d’Hebron (VHIR), el Instituto Oncológico del Vall d’Hebron (VHIO), el Instituto de Investigación Biomédica de Bellvitge (IDIBELL), el Institut Hospital del Mar d’Investigacions Mèdiques (IMIM-Mar) y el Instituto de Investigación del Sida (IrsiCaixa), ha sido cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) a través del Programa Operativo de Crecimiento Inteligente 2014-2010 y por el Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI), apoyado por el Ministerio de Economía y Competitividad (CDTI IDI-20151125).

PANA H2020 Project: Promoting active ageing: functional nanostructures for Alzheimer’s disease at ultra-early stages.

La enfermedad de Alzheimer (EA) es la más importante causa de demencia y pérdida de autonomía entre la población anciana, implicando disminución y limitaciones en las actividades sociales. El progresivo envejecimiento de la población europea incrementará la magnitud de este problema en las próximas décadas. Actualmente no existe ningún método efectivo para la diagnosis temprana de EA. Por todo ello hay una urgente necesidad de desarrollar nuevos métodos de diagnóstico efectivos en fases tempranas de la enfermedad, junto con estrategias terapéuticas que ayuden a retrasar la aparición de los síntomas más adversos. Para vencer este reto el proyecto PANA se basa en la importancia de los oligómeros tau en los procesos pato-fisiológicos tempranos de la enfermedad. La estrategia efectiva del proyecto se basa en dos pilares fundamentales:

• Desarrollo de métodos de imagen por PTE/MR, que están ganado relevancia como una solución innovadora para el diagnóstico debido a su complementariedad, combinando la información altamente estructural del tejido que proporciona la MRI, con la alta sensibilidad y especificidad de la imagen por PET.
• Desarrollar nanoestructuras teragnósticas con capacidad para la detección de oligómeros tau, en combinación con la capacidad de dirigir agentes teragnósticos en el cerebro para obtener diagnóstico y tratamiento in-situ.

El proyecto PANA se focaliza en el desarrollo de nanoestructuras teragnósticas que reconozcan específicamente marcadores de fases muy tempranas de EA, que puedan detectarse por métodos no invasivos basados en imagen (MRI / PET) y que eventualmente proporcionen acción terapéutica si se requiere.

El consorcio europeo en el que participa Roche dentro del proyecto PANA* está financiado por Fondos Europeos bajo convocatoria H2020-NMP-2014-2015 (Call for Nanotechnologies, advanced materials and production) y Grant Agreement No: 686009

*Consorcio PANA: Servizo Galego de Saúde (SERGAS)-Fundación Ramón Domínguez (España), Universidade de Santiago de Compostela (España), International Iberian Nanotechnology Laboratory (Portugal), Katholieke Universiteit Leuven (Bélgica), ReMYND NV (Bélgica), STAB Vida (Portugal), Stichting VU-VUMC (Holanda), University of Eastern Finland (Finlandia), Roche Diagnostics (España), Biotechpharma (Lituania), Fundación Instituto de Estudios de Ciencias de la Salud de Castilla y León (España)

https://panaproject.eu/

ADMARKERS: Marcadores tempranos de Alzheimer mediante la combinación de técnicas avanzadas de imagen y diagnóstico in-vitro.

La enfermedad de Alzheimer es un trastorno neurodegenerativo progresivo e irreversible que representa aproximadamente del 60% al 80% de todos los casos de demencia a nivel mundial. Existe un consenso amplio sobre la necesidad de desarrollar nuevas aproximaciones terapéuticas y métodos diagnósticos que permitan detectar la enfermedad en fases tempranas, favoreciendo por un lado el ensayo de actuaciones terapéuticas cuando todavía es posible revertir el curso de la enfermedad y permitiendo, por otro lado, un mejor manejo clínico del paciente de Alzheimer de tal manera que se puedan retrasar los síntomas de la misma. Dado que los progresos para encontrar una terapia efectiva por la vía de comprender y combatir la progresión de placas de proteína β-amiloide alrededor de las neuronas aún no han cristalizado, los investigadores están prestando una creciente atención a otros mecanismos moleculares relacionados con la enfermedad, como son la agregación de la proteína Tau asociada a los microtúbulos en ovillos neurofibrilares dentro de las células. Viendo el importante rol que juega en el avance de la enfermedad la proteína Tau, el desarrollo de nuevos anticuerpos específicos para diferentes especies de dicha proteína (principalmente Tau acetilado -Ac-Tau- y Tau fosforilado –p-Tau-), podría contribuir a la lucha contra la enfermedad de forma significativa, mediante dos vías:

1. Desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico para la detección temprana de la enfermedad.

2. Desarrollo de nuevas terapias basadas en dianas dirigidas a aquellas especies de la proteína Tau que pueden contribuir al desarrollo de la patología.

El proyecto, en colaboración con las empresas Lincbiotech y BIOD, y la participación del Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago de Compostela (FIDIS), la University of Eastern Finland (UEF) y la empresa STABvida, ha sido cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER) a través del Programa Operativo de Crecimiento Inteligente 2014-2020 y por el Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI), apoyado por el Ministerio de Economía y Competitividad (CDTI IDI-20190799).

La aparición de infecciones emergentes o reemergentes de virus y bacterias, y su alta capacidad de generar resistencias o multi-resistencias a sus tratamientos, es un fenómeno recurrente e impredecible, con graves consecuencias sociales y económicas. Un claro e impactante ejemplo de esto ha sido la grave pandemia de COVID-19 generada tras la irrupción del coronavirus SARS-Cov-2. En este sentido se ha identificado la necesidad, en el sistema sanitario, de disponer de plataformas genómica basadas en secuenciación masiva para estudiar estos tipos de enfermedades infecciosas. El objetivo global del presente proyecto se centra, por tanto, en desarrollar nuevas soluciones de uso e interés asistencial en el campo de la microbiología clínica, como base para la creación de una plataforma centralizada de alta precisión para agentes infecciosos emergentes, que permita abordar, por ejemplo, retos como la aparición de nuevos subtipos de virus de hepatitis C, la identificación de resistencias a antibióticos en Mycobacterium tuberculosis, o el genotipado de nuevos virus como el SARS-Cov-2.

Este proyecto es una colaboración con el Institut de Recerca del Vall d’Hebron (VHIR) y el Centro de Investigación Biomédica en Red en el Área Temática de Enfermedades Hepáticas y Digestivas (CIBERehd), y ha sido cofinanciado por el Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI), apoyado por el Ministerio de Economía y Competitividad (CDTI IDI-20200297).

Los pólipos colorrectales son precursores del cáncer colorrectal, aunque la transformación neoplásica puede tardar años. Por este motivo, el cribado poblacional que permite el diagnóstico precoz de estas lesiones resulta fundamental para la prevención de este tipo de cáncer.

El proyecto AIDPathology pondrá en marcha un sistema de fragmentación y anotación de imágenes de lesiones polipoides intestinales de cáncer colorrectal, para entrenar y validar un algoritmo de soporte a la clasificación de estas lesiones. La finalidad de esta herramienta integrada es combinar la experiencia del patólogo/a con el soporte de las herramientas digitales y la Inteligencia Artificial, lo que permitirá reducir el tiempo de respuesta y mejorar la concordancia y exactitud de los diagnósticos, con la subsiguiente optimización en el tratamiento y pronóstico del paciente.

El algoritmo resultante será compatible con la solución de patología digital de Roche, e integrable en el software de gestión de imágenes y casos NAVIFY Digital Pathology, permitiendo su uso en un flujo de trabajo equivalente al del diagnóstico clínico.

El proyecto se llevará a cabo durante 2022 y 2023, y es una colaboración con el Hospital Clínic de Barcelona y la empresa Enzyme Advising Group, contando con la financiación del Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI IDI-20220417) y el apoyo del Ministerio de Ciencia e Innovación.

El Proyecto NEXTHREAT es una colaboración de ROCHE DIAGNOSTICS con el Centro de Investigación en Salud Animal del Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (CISA-INIA/CSIC), el Centro Nacional de Microbiología (CNM) del Instituto de Salud Carlos III, la Estación Biológica de Doñana del CSIC, y la empresa Eurofins-Ingenasa.

El proyecto tiene como principal objetivo el establecer un enfoque de One Health para explorar tecnologías ya disponibles para rastrear el conjunto de virus ambientales presentes en el medio natural con el fin de implementar estrategias efectivas para la detección de virus emergentes, potencialmente dañinos para el ganado y la salud humana, y así permitir su prevención y control.

En colaboración con el Centro de Investigación en Salud Animal del Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (CISA-INIA/CSIC), el Centro Nacional de Microbiología (CNM) del Instituto de Salud Carlos III, la Estación Biológica de Doñana del CSIC, y la empresa Eurofins-Ingenasa.

Este proyecto de I+D+i se realiza en el marco de las ayudas de Líneas Estratégicas, nºPLEC2021-007968, y está financiado por MCIN/AEI/10.13039/501100011033/ “Unión Europea NextGenerationEU/PRTR”.