AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2
Ottenere informazioni genomiche preziose per potenziare la ricerca e promuovere la medicina di precisione
AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2 è un test interno con sequenziamento genetico di nuova generazione (NGS), utilizzabile a solo scopo di ricerca, che fornisce la profilazione genomica completa dei tumori solidi da campioni di DNA derivati da tessuto fissati in formalina e immersi in paraffina (FFPE). Con un pannello di 335 geni allineato con il design del pannello FoundationOne® CDx e strumenti di bioinformatica utilizzabili tramite la piattaforma di analisi FoundationOne®, il kit sfrutta la comprovata tecnologia di Foundation Medicine e l’esperienza di Roche per aiutare i laboratori a ottenere informazioni genomiche affidabili.1-3
Prestazioni analitiche di AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2
Visualizza tabella completaPrestazioni analitiche di AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2
Classificazione |
Varianti/Firme rilevate |
Varianti brevi |
99,7% |
Riarrangiamenti |
89,9% |
CNA |
99,6% |
MSI alta |
100% |
TMB alto |
100% |
gLOH alta |
100% |
HRDsig positiva |
91,7% |
I risultati sono ricavati da 60 milioni di letture per campione su Illumina NextSeq 550 (~ 12 campioni per cella di flusso) per determinare le prestazioni tramite confronto con il metodo di riferimento (FoundationOne® CDx). Per questa analisi, le firme elevate o positive sono state definite come segue: MSI alta ≥ 0,0124, TMB alto ≥ 10,0 mutazioni/Mb, gLOH positiva ≥ 0,16 e HRDsig positiva ≥ 0,7. Sono stati esclusi i campioni con punteggi negli intervalli marginali: MSI (0,0041-0,0124; stato "equivoco"), TMB (8,0-12,0 mutazioni/Mb) e gLOH (0,14-0,18).
AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2 è un test a scopo esclusivo di ricerca e non deve essere utilizzato per procedure diagnostiche. Gli utilizzatori devono determinare i limiti delle firme complesse in base alle loro esigenze di ricerca.
Specifiche di AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2
Visualizza tabella completaSpecifiche di AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2
Specifiche del prodotto |
Valore |
Pannello |
Pannello di 335 geni allineato con il design del pannello FoundationOne® CDx Misurazione di 4 alterazioni genomiche (SNV, InDel, RE e CNA) sulla base di analisi del DNA oltre a 4 firme complesse (MSI, TMB, gLOH e HRDsig)*, ** |
Tipo di campione |
Tessuto o DNA derivato da tessuto fissato in formalina e immerso in paraffina (FFPE) |
Reagenti |
Reagenti privi di xilene conformi al regolamento REACH Confezione da 24 reazioni |
Sequenziamento |
Illumina NextSeq 500/550/550Dx (modalità RUO): fino a 12 campioni in una cella di flusso ad alta resa* Illumina NovaSeq 6000: fino a 24 campioni in una cella di flusso SP; fino a 48 campioni in una cella di flusso S1 (opzione di test esplorativo)† Multiplexing di campioni CGP e non CGP nella stessa cella di flusso a condizione che i codici a barre non entrino in conflitto‡ |
Flusso di lavoro |
Flusso di lavoro manuale |
Analisi dei dati |
Piattaforma di analisi FoundationOne® per l’analisi secondaria dei dati Compatibilità ottimizzata con navify® Mutation Profiler per l’analisi terziaria e la generazione di report, ferma restando la possibilità di utilizzo di qualsiasi software per analisi terziarie§ |
Tempo di elaborazione |
Fino a 5 giorni dall’estrazione del DNA alla generazione dei risultati* |
**Chen KT et al. A Novel HRD Signature Is Predictive of FOLFIRINOX Benefit in Metastatic Pancreatic Cancer. Oncologist. 2023 Aug 3;28(8):691-698. Doi: 10.1093/oncolo/oyad178.
†F. Hoffmann-La Roche Ltd. AVENIO Connect Instructions for Use. (v2.4). 2025.
‡Ahmed, A., et al. Mixed batching of AVENIO Tumor Tissue CGP samples with various non-CGP sample libraries for enhanced sequencing flexibility. Poster presentato al meeting annuale dell’Association for Diagnostics and Laboratory Medicine (ADLM), Chicago, IL, USA a luglio 2025.
§F. Hoffmann-La Roche Ltd. navify® Mutation Profiler Instructions for Use. (v2.6). 2025.
navify® Mutation Profiler
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Il portfolio AVENIO Tumor Tissue CGP Kit, comprensivo di software AVENIO Connect, è solo per finalità di ricerca. Non utilizzare nelle procedure diagnostiche. Il software AVENIO Connect è incluso nel prezzo di AVENIO Tumor Tissue CGP Automated Kit.
navify® Mutation Profiler ha ottenuto la marcatura CE-IVD nella UE. Negli Stati Uniti, navify® Mutation Profiler è solo a scopo di ricerca (RUO).
navify® Mutation Profiler per le analisi terziarie non fa parte di AVENIO Tumor Tissue CGP Automated Kit e deve essere acquistato come dispositivo aggiuntivo opzionale.
I reagenti AVENIO Edge e i flussi di lavoro hanno esclusivamente finalità di ricerca quando utilizzati insieme al portfolio AVENIO Tumor Tissue CGP Kit. Non utilizzare nelle procedure diagnostiche.
AVENIO Edge System e i relativi consumabili non fanno parte di AVENIO Tumor Tissue CGP Automated Kit e devono essere acquistati come dispositivi aggiuntivi obbligatori.
Riferimenti bibliografici
- F. Hoffmann-La Roche Ltd. Dati in archivio.
- Choi et al. Evolution of a Comprehensive Genomic Profiling (CGP) Kit to Simplify Workflows and Detect Homologous Recombination Deficiency. Presentato a: Association of Molecular Pathology Europe; 24-26 giugno 2024; Madrid, Spagna. #ST-19. Disponibile all’indirizzo: https://medically.roche.com/global/en/oncology/amp-eu-2024/medical-material/AMP-EU-2024-poster-zhang-evolution-of-a-comprehensive-pdf.html
- F. Hoffmann-La Roche Ltd. AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2 Instructions for Use. (v1.0). 2024.
- Foundation Medicine® Clinical Development e CDx. [Internet; citato il 1 luglio 2024]. Disponibile all’indirizzo: https://www.foundationmedicine.com/info/biopharma-overview
- Chen KT et al. A Novel HRD Signature Is Predictive of FOLFIRINOX Benefit in Metastatic Pancreatic Cancer. Oncologist. 2023 Aug 3;28(8):691-698.