AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2

RUO For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2
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Gewinnen Sie Einblicke in das Genom, um Ihre Forschung zu stärken und die Präzisionsmedizin zu fördern

Das AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2 ist ein In-house-Next-Generation-Sequencing- (NGS) Research-Use-Only-Assay, das ein Comprehensive Genomic Profiling solider Tumore aus DNA-Proben ermöglicht, die aus formalinfixiertem, paraffineingebettetem (FFPE) Gewebe gewonnen wurden. Mit einem Panel aus 335 Genen, abgestimmt mit dem FoundationOne® CDx-Panel und Bioinformatik unter Verwendung der FoundationOne®-Analyseplattform, wurde das Kit anhand der bewährten Technologie von Foundation Medicine und dem Know-how von Roche entwickelt, damit Labore zuverlässige Einblicke in das Genom erhalten.1–3

Die Vorteile auf einen Blick

Die Vorteile auf einen Blick

Icon of a lightbulb surrounded by concentric rings demonstrating the innovative expertise of Roche and Foundation Medicine

Nutzung der Expertise in personalisierter Medizin und umfassendem genomischen Profiling: über 1.000 Peer-Reviewed-Publikationen, mehr als 1,3 Millionen bereitgestellte CGP-Befunde.1,4

Icon of a gene on a laptop screen representing the genomic coverage of the AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2

Vielfältige und umfassende Genom-Abdeckung, Analyse von 335 relevanten Genen, vier Klassen Genomveränderungen und komplexen genomischen Signaturen, einschliesslich Tumormutationslast (TMB), Mikrosatelliteninstabilität (MSI), genomischem Verlust der Heterozygotie (gLOH) und der neu hinzugekommenen homologen Rekombinationsdefizienzsignatur (HRDsig).2, 3, 5

Icon of three arrows joined in a circle representing the fast and complete workflow of the AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2

Ein Arbeitsgang von der DNA-Extraktion bis zur Datenanalyse. Schnelle 2-tägige Library Preparation und kurze 1-stündige Ligation mit einer Gesamtdurchlaufzeit von 5 Tagen von der DNA-Extraktion bis zur Ergebnisgenerierung.2, 3

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Analyseleistung des AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2

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Analyseleistung des AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2

 

Klassifizierung

Festgestellte Varianten/Signaturen

Short Variants

99,7 %

Rearrangements

89,9 %

CNA

99,6 %

MSI hoch

100 %

TMB hoch

100 %

gLOH hoch

100 %

HRDsig positiv

91,7 %
Solide analytische Variantenerkennung über Genomveränderungen und Signaturen hinweg.
Die Ergebnisse stammen aus 60 Millionen Lesevorgängen pro Probe auf Illumina NextSeq 550 (~12 Proben pro Flowcell), um die Leistung durch Vergleich mit der Referenzmethode (FoundationOne® CDx) zu bestimmen. Für diese Analyse wurden hohe oder positive Signaturen wie folgt definiert: MSI hoch ≥ 0,0124, TMB hoch ≥ 10,0 Mutationen/Mb, gLOH-positiv ≥ 0,16 und HRDsig-positiv ≥ 0,7. Proben mit Werten im Randbereich, MSI (0,0041–0,0124; „unbestimmter“ Status), TMB (8,0–12,0 Mutationen/Mb) und gLOH (0,14–0,18) wurden ausgeschlossen.
Das AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2 ist ausschliesslich für die Forschung bestimmt und sollte nicht für diagnostische Verfahren verwendet werden. Anwender müssen die komplexen Signatur-Cut-offs auf der Grundlage ihrer Forschungsbedürfnisse bestimmen.

AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2 – Spezifikationen

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AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2 – Spezifikationen

Produktspezifikationen

Wert

Panel

335-Gen-Panel, abgestimmt auf das FoundationOne® CDx-Panel-Design

Zur Messung von 4 genomischen Veränderungen basierend auf der DNA-Analyse – Einzelnukleotidvarianten (SNV), Insertionen und Deletionen (InDel), Rearrangements (RE) und Kopienzahlveränderungen (CNA) zusammen mit 4 komplexen Signaturen – Mikrosatelliteninstabilität (MSI), Tumormutationslast (TMB), genomischer Verlust der Heterozygotie (gLOH) und homologe Rekombinationsdefizienz-Signatur (HRDsig)*, **

Probentyp

Formalinfixiertes, paraffineingebettetes (FFPE) Gewebe oder DNA aus FFPE-Gewebe

Reagenzien

REACH-konforme, Xylol-freie Reagenzien

24 Reaktionspackungsgrössen

Sequencing

Illumina NextSeq 500/550/550Dx (RUO-Modus): Bis zu 12 Proben in einer High-Output-Flowcell*

Illumina NovaSeq 6000: Bis zu 24 Proben in einer SP-Flowcell; bis zu 48 Proben in einer S1-Flowcell (explorative Testoption)†

Multiplexing von CGP- und Nicht-CGP-Proben in derselben Flowcell, solange keine Konflikte zwischen den Barcodes bestehen‡

Workflow

Manueller Workflow

Datenanalyse

FoundationOne® Analyseplattform für die sekundäre Datenanalyse
AVENIO Connect Software für das Datenmanagement

Optimierte Kompatibilität mit dem navify® Mutation Profiler für die tertiäre Analyse und die Berichterstellung; der Anwender kann jedoch jede tertiäre Analysesoftware verwenden§

Durchlaufzeit

Bis zu 5 Tage von der DNA-Extraktion bis zur Ergebnisgenerierung*

 

* F. Hoffmann-La Roche Ltd. AVENIO Tumor Tissue CGP Automated Kit Instructions for Use. (v1.0). 2025.
**Chen KT et al. A Novel HRD Signature Is Predictive of FOLFIRINOX Benefit in Metastatic Pancreatic Cancer. Oncologist. 2023 Aug 3;28(8):691-698. Doi: 10.1093/oncolo/oyad178.
†F. Hoffmann-La Roche Ltd. AVENIO Connect Instructions for Use. (v2.4). 2025.
‡Ahmed, A., et al. Mixed batching of AVENIO Tumor Tissue CGP samples with various non-CGP sample libraries for enhanced sequencing flexibility. Poster presented at the Association for Diagnostics and Laboratory Medicine (ADLM) Annual Meeting, Chicago, IL, USA, July 2025.
§F. Hoffmann-La Roche Ltd. navify® Mutation Profiler Instructions for Use. (v2.6). 2025.
A clinician in a lab coat sits at her desk in front of a computer reviewing the output from navify mutation profiler

navify® Mutation Profiler

Vereinfachen Sie die tertiäre NGS-Analyse und erschliessen Sie schnell und sicher verwertbare Daten.

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    Das AVENIO Tumor Tissue CGP Kit-Portfolio, einschliesslich der AVENIO Connect-Software, ist nur für Forschungszwecke bestimmt. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren. Die AVENIO Connect Software ist im Preis des AVENIO Tumor Tissue CGP Automated Kit enthalten.

    navify® Mutation Profiler hat in der EU die CE-Kennzeichnung für In-vitro-Diagnostika (IVD). Nur zu Forschungszwecken, nicht zur Verwendung in diagnostischen Verfahren in den USA und anderen Ländern bei Verwendung mit den AVENIO Tumor Tissue CGP Kits. Die Tertiäranalyse mit dem navify® Mutation Profiler ist nicht Teil des AVENIO Tumor Tissue CGP Automated Kit und sollte als optionales Add-on erworben werden.

    AVENIO Edge-Reagenzien und -Workflows sind nur für Forschungszwecke bestimmt, wenn Sie mit dem AVENIO Tumor Tissue CGP Kit-Portfolio verwendet werden. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.

    Das AVENIO Edge System und die Verbrauchsmaterialien sind nicht Teil des AVENIO Tumor Tissue CGP Automated Kit und sollten als obligatorisches Zubehör erworben werden.

    Literatur

    1. F. Hoffmann-La Roche Ltd. Archivdaten.
    2. Choi et al. Evolution of a Comprehensive Genomic Profiling (CGP) Kit to Simplify Workflows and Detect Homologous Recombination Deficiency. Präsentiert bei: Association of Molecular Pathology Europe; 24.–26. Juni 2024; Madrid, Spanien. #ST-19. Verfügbar unter: https://medically.roche.com/global/en/oncology/amp-eu-2024/medical-material/AMP-EU-2024-poster-zhang-evolution-of-a-comprehensive-pdf.html.
    3. F. Hoffmann-La Roche Ltd. AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2 Gebrauchsanweisung. (v1.0). 2024.
    4. Foundation Medicine® Clinical Development and CDx. [Internet; abgerufen am 1. Juli 2024]. Verfügbar unter: https://www.foundationmedicine.com/info/biopharma-overview.
    5. Chen KT et al. A Novel HRD Signature Is Predictive of FOLFIRINOX Benefit in Metastatic Pancreatic Cancer. Oncologist. 2023 Aug 3;28(8):691-698.