KAPA Cleanup Beads

KAPA HyperPure Beads sind für die Verwendung mit verschiedenen Forschungs-Workflows zur DNA- und RNA Library Preparation optimiert:

• DNA Library Preparation-Workflows, einschliesslich KAPA EvoPlus V2 Kits und KAPA EvoPrep Kits
• RNA Library Preparation-Workflows, einschliesslich KAPA RNA EvoPrep Kits

• Kompatibel mit KAPA DNA und RNA Library Preparation-Protokollen
• Vergleichbare Ausbeute und Grössenverteilung im Vergleich zu branchenführenden Anbietern
• Leicht in bestehende Automatisierungsanwendungen integrierbar

Abbildung 1: KAPA HyperPure Beads weisen in DNA-Workflows eine überlegene Wiederfindungsleistung gegenüber Anbieter A auf.

Abb. 1 zeigt die Wiederfindung unfragmentierter humaner genomischer DNA (gDNA). KAPA HyperPure Beads und Beads von Anbieter A wurden in einem 3X-Verhältnis verwendet, um DNA-Eingaben verschiedener Mengen zu reinigen. Die Wiederfindung wurde vor und nach der Reinigung mit dem Qubit Fluorometer 3 dsDNA HS Assay Kit gemessen.

Abbildung 2: KAPA HyperPure Beads weisen in DNA-Workflows eine überlegene Wiederfindungsleistung gegenüber Anbieter A auf.

Abbildung 2 zeigt die Wiederfindung von stark und mässig abgebauter formalinfixierter, paraffineingebetteter (FFPE) humaner genomischer DNA. Hochgradig abgebaute DNA, erhalten aus FFPE-Proben der klinischen Forschung (n = 12); mässig abgebaute DNA, erhalten aus Horizon Reference FFPE DNA (n = 9). KAPA HyperPure Beads und Beads von Anbieter A wurden in einem 3X-Verhältnis verwendet, um DNA-Eingaben verschiedener Mengen zu reinigen. Die Wiederfindung wurde vor und nach der Reinigung mit dem Qubit Fluorometer 3 dsDNA HS Assay Kit gemessen.

• Reproduzierbare Grössenauswahl von Nukleinsäuren – Erfassung von fragmentierter Input-DNA, adapterligierten Molekülen oder amplifizierten Libraries in NGS Library Preparation-Workflows
• Ermöglicht Forschern die konsistente Auswahl von Fragmentgrössen von Interesse ohne Bias
• Schnelle, effiziente Reaktionsreinigung entfernt Adapter, Adapterdimere, Primer, Primer-Dimere, Nukleotide, Salze und Enzyme
• KAPA HyperPure Beads sind gebrauchsfertig und automatisierungsfreundlich

Abbildung 3: KAPA HyperPure Beads bieten eine anpassbare Grössenauswahl für doppelsträngige DNA.

Bei jedem Schritt des Library Preparation-Workflows wurde DNA einer doppelseitigen Grössenauswahl unter Verwendung verschiedener Bead-zu-Probe-Verhältnisse (siehe Legende) unterzogen und dann mit einem Bioanalyzer® 2100 High Sensitivity Kit auf Grössenverteilung analysiert (Abbildung 3). Für jedes Panel wird der resultierende Fragmentgrössenbereich im Vergleich zu DNA des gleichen Stadiums gezeigt, die nicht grössenselektiert wurde. Die DNA-Konzentrationen wurden vor dem Beladen des Bioanalyzers normalisiert. Diese Ergebnisse stellen die Grössenauswahl der Input-DNA nach der Fragmentierung dar. Hochqualitative hgDNA wurde unter Bedingungen, die für den Erhalt einer Modusfragmentlänge von 250–400 bp optimiert wurden, mechanisch mit einem Covaris® E220 Focused Ultrasonicator fragmentiert und dann einer Grössenauswahl unterzogen.

Abbildung 4: KAPA HyperPure Beads ermöglichen eine anpassbare Grössenauswahl für doppelsträngige DNA.

Bei jedem Schritt des Library Preparation-Workflows wurde DNA einer doppelseitigen Grössenauswahl unter Verwendung verschiedener Bead-zu-Probe-Verhältnisse (siehe Legende) unterzogen und dann mit einem Bioanalyzer® 2100 High Sensitivity Kit auf Grössenverteilung analysiert. Für jedes Panel wird der resultierende Fragmentgrössenbereich im Vergleich zu DNA des gleichen Stadiums gezeigt, die nicht grössenselektiert wurde. Die DNA-Konzentrationen wurden vor dem Beladen des Bioanalyzers normalisiert. Grössenauswahl nach der Amplifikation. Libraries wurden amplifiziert und die endgültigen Libraries wurden dann einer Grössenauswahl unterzogen.