KAPA HyperCap Custom Probes

Hybridization-based target enrichment probes for custom panel design
RUO For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

Vollständig anpassbare Panels für das hybridisierungsbasierte Capture

Durch Hybridisierung oder erfassungsbasiertes Target Enrichment können Forscher spezifische Zielregionen für das Next Generation Sequencing (NGS) anreichern.

Die mit einem Jahrzehnt Erfahrung im Sondendesign sowie einem verbesserten Verfahren hergestellten kundenspezifischen Roche KAPA HyperCap Target Enrichment-Sonden ermöglichen zusammen mit dem HyperDesign-Tool für kundenspezifisches Online-Target-Panel-Design eine höhere Sondengenauigkeit und ein verbessertes hybridisierungsbasiertes Target Enrichment bei Erfassung für NGS. 

Es gibt zwei Arten von kundenspezifischen KAPA HyperCap Custom Probes: KAPA HyperChoice-Sonden für humane Designs und KAPA HyperExplore-Sonden für nicht-humane Designs. 

Unser kundenspezifisches Portfolio an KAPA HyperChoice- und KAPA HyperExplore-Sonden sowie unsere anderen Reagenzien und Zubehörprodukte unterstützen Wissenschaftler dabei, ihren Arbeitsablauf für das Target Enrichment zu verbessern und Sequencing-Kosten zu verringern.

Die Vorteile auf einen Blick

Die Vorteile auf einen Blick

Analyseleistung von zwei KAPA HyperChoice Designs

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Analyseleistung von zwei KAPA HyperChoice Designs

Design

Neurodegenerativ

Erbkrankheit

Gene

> 98

> 4100

Zielgröße (Erfassung)

335 Kb

12,3 Mb

HQ-Reads

1,75 M

20,00 M

System

NovaSeq 6000

NovaSeq 6000

% Duplikate gesamt

2,78

1,62

Fold 80 (Uniformität)

1,38

1,43

% Basen ≥ 30X

99,83

97,22

Designs der ersten Iteration zeigen bei Ausführung auf einem NovaSeq 6000 System geringe PCR-Duplikation mit hoher Uniformität (geringe Fold80-Base-Penalty) und breiter Target Coverage (% der abgedeckten Basen bei ≥ 30X). Beide Designs wurden mit dem KAPA HyperCap Workflow v3.0 erstellt, beginnend mit 100 ng NA12891-DNA. Metriken sind der Durchschnitt aus sechs Wiederholungen einzelner Erfassungen pro Design.

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HyperDesign Tool

Das HyperDesign Tool basiert auf zwei Jahrzehnten Erfahrung in der In-Silico-Konstruktion, damit Sondenpanels ausgewählt werden, die eine tiefere, einheitlichere Abdeckung des Downstream-Sequencing mit weniger Sequencing-Ablesungen erreichen – selbst über schwer erfassbare Regionen hinweg.

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Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.